工伤赔偿款双方协议好的时间过了，协议是否有效需根据具体情况综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、协议有效的情形
双方自愿且内容合法：
- 如果工伤赔偿协议是双方在平等、自愿的基础上，经过充分协商达成的，且协议内容符合《工伤保险条例》及相关法律法规的规定，如赔偿项目和赔偿金额均按照法定标准确定，那么即使过了协议约定的时间，该协议仍然是有效的。
- 例子：劳动者与用人单位就工伤赔偿事宜达成一致，签订了书面协议，约定了赔偿金额、支付方式等，且均符合法律规定。过了协议时间后，用人单位仍应按照协议履行赔偿义务。
形式合法且要素完备：
- 协议的形式应符合法律规定，通常要求书面形式，并由双方签字或盖章确认。同时，协议还需具备其他必要要素，如明确的赔偿项目、金额、支付方式等。如果这些要素都完备，且过了协议时间，协议依然有效。
二、协议可能无效或可撤销的情形
违反法律法规强制性规定：
- 如果协议内容违反了法律法规的强制性规定，如约定的赔偿金额明显低于法定标准，或者排除了劳动者依法应享有的某些重要权益，那么即使过了协议时间，该协议也可能被认定为无效。
- 例子：协议中约定的伤残赔偿金额远低于法定标准，劳动者有权要求按照法定标准重新计算赔偿金额。
存在欺诈、胁迫或乘人之危等情形：
- 若用人单位利用自身优势或劳动者的不利处境，通过欺诈、胁迫或乘人之危等手段，迫使劳动者签订明显不公平的赔偿协议，劳动者有权申请撤销该协议。过了协议时间，如果劳动者能证明存在这些情形，协议仍可能被撤销。
- 例子：用人单位在劳动者急需治疗费用时，迫使劳动者接受不合理的赔偿条件。劳动者事后可以主张撤销该协议。
显失公平：
- 如果赔偿协议中双方的权利义务明显不对等，对劳动者一方极为不利，且这种不对等并非基于劳动者的真实意愿，那么即使过了协议时间，该协议也可能因显失公平而被撤销。
- 例子：劳动者因工伤造成了严重的身体残疾，但协议中给予的赔偿金额仅能勉强支付前期的医疗费用，对于劳动者后续的生活和康复没有任何保障。这种情况下，协议可能会被认定为显失公平而被撤销。
三、特殊情形的处理
未进行工伤认定和劳动能力鉴定前达成的协议：
- 在这种情况下，由于双方对工伤的事实和赔偿标准缺乏准确的认识，所签订的协议可能存在较大的不确定性。如果后续经过工伤认定和劳动能力鉴定，发现实际情况与协议约定不符，劳动者可以根据新的鉴定结果，要求重新协商赔偿事宜或者通过法律途径解决争议。过了协议时间，这一原则依然适用。
协议内容部分有效、部分无效：
- 如果工伤赔偿协议中的部分内容符合法律规定，而部分内容违反了法律规定或者显失公平，那么法院或仲裁机构可能会根据具体情况，确认部分条款有效，部分条款无效。过了协议时间，这一判断标准依然有效。
法律建议：
- 在签订工伤赔偿协议时，双方应谨慎对待，确保协议内容合法、公平、合理。劳动者应充分了解自己的权益和法定的赔偿标准，避免在不知情或被迫的情况下签订不公平的协议。
- 用人单位也应遵守法律法规，不得利用自身优势压迫劳动者接受不合理的赔偿条件。
- 如果过了协议时间，双方对协议效力有争议，建议及时咨询专业律师，通过法律途径解决争议。
可能法律后果：
- 如果协议被认定为有效，用人单位应按照协议履行赔偿义务。
- 如果协议被认定为无效或可撤销，劳动者有权要求按照法定标准重新计算赔偿金额，或者通过法律途径维护自己的合法权益。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。