员工休病假半个月，公休期间是有工资的，且公司扣发工资的行为一般不合法。以下从不同角度为您详细分析：
一、病假工资的法律依据
根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及《劳动法》的相关规定，员工在医疗期内（即病假期间），用人单位应当按照不低于当地最低工资标准的80%支付病假工资或者疾病救济费。这意味着，即使您在病假期间没有实际工作，公司也需要支付您一定的工资，以保障您的基本生活需求。
二、病假工资的计算方式
医疗期内的工资支付：
- 如果您的医疗期在6个月以内，公司应按照不低于本人工资的60%（或当地最低工资标准的80%，以较高者为准）支付病假工资。
- 具体计算公式可能因地区而异，但一般原则是确保病假工资不低于当地最低工资标准的一定比例。
医疗期外的处理：
- 如果医疗期满后，您仍不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位可以解除劳动合同，但需要按照《劳动合同法》的规定支付经济补偿。
- 经济补偿的计算方式通常是按照您在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向您支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向您支付半个月工资的经济补偿。
三、公司扣发工资的合法性分析
- 不合法情况：如果公司未按照上述规定支付病假工资，或者以其他理由扣发您的工资，那么公司的行为一般是不合法的。您有权要求公司补发工资，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 合法情况：当然，如果公司有合理的规章制度，并且这些规章制度经过了民主程序制定、公示，且不违反法律法规的强制性规定，那么在某些特定情况下（如严重违反公司规章制度等），公司可能有权扣除部分工资。但这种情况并不适用于病假期间。
四、建议与行动
- 与公司沟通：首先，您可以尝试与公司沟通，了解公司扣发工资的具体原因，并要求公司按照法律规定支付病假工资。
- 收集证据：如果沟通无果，您需要收集相关证据，如病假证明、工资条、公司规章制度等，以备后续维权之需。
- 寻求法律援助：如果公司仍然拒绝支付病假工资，您可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
总结：员工在病假期间是有权获得工资的，公司扣发工资的行为一般不合法。如果您遇到了类似的问题，建议按照上述步骤进行维权。如果您还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。