工厂强制员工上周六日上班来调星期二休息，其合法性主要取决于具体的工时制度、调休安排是否经过协商或审批，以及是否违反了《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规的规定。以下是从不同角度进行的分析：
一、标准工时制下的合法性分析
合法情形：
- 在标准工时制下，即劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时，且用人单位应保证劳动者每周至少休息一日的制度下，若工厂因生产经营需要，在与工会和劳动者协商后，安排周六日加班并随后进行调休（如调至星期二休息），此做法是合法的。依据《劳动法》第四十四条，若休息日工作后能安排补休，则无需支付额外加班工资。
不合法情形：
- 若工厂未经与工会和劳动者协商，强制安排周六日上班并调休，则侵犯了劳动者的休息休假权利，属于违法行为。劳动者有权拒绝此类安排，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
二、综合计算工时工作制下的合法性分析
合法情形：
- 对于部分特殊工作性质的企业，如交通、铁路、邮电等，可实行综合计算工时工作制，即按周、月、季、年等周期综合计算工作时间，但平均日工作时间和周工作时间应与法定标准相符。在此制度下，若工厂已获劳动行政部门批准实行该工时制度，并合理采用集中工作、集中休息等方式，且劳动者总实际工作时间未超过法定标准，则强制安排周六日上班并调休是合法的。
不合法情形：
- 若工厂未获批准实行综合计算工时工作制，或在综合计算周期内劳动者总实际工作时间超标且未依法支付加班工资，即使安排调休也属违法。劳动者有权要求工厂支付加班工资或拒绝此类安排。
三、不定时工作制下的特殊情况
- 对于不定时工作制的劳动者，一般不存在周六日工作的调休或加班工资问题。因为不定时工作制适用于无法按标准工作时间衡量的岗位，如高级管理人员、外勤人员等。但需注意，部分地区可能对法定节假日工作有特别规定，如需支付加班工资。若工厂在不定时工作制下强制安排周六日上班并调休，且未遵循相关地区规定，则可能构成违法。
四、调休安排的合理性
- 无论何种工时制度，调休安排均需合理，避免频繁变动或调休时间过长过短，以免影响员工的正常生活和休息。若调休安排不合理，即使符合工时制度也可能被视为不合法行为。例如，若调休导致劳动者连续工作过长时间而得不到充分休息，则可能违反《劳动法》中关于劳动者休息权利的规定。
五、建议与总结
劳动者应明确自身权益：了解并熟悉《中华人民共和国劳动法》的相关规定，确保自己的休息权利和加班费支付得到保障。若工厂强制安排周六日上班并调休，且未遵循相关法律法规或协商程序，劳动者有权拒绝并维护自身权益。
积极沟通协商：与工厂就工作时间和调休安排进行积极沟通，确保双方达成一致意见。若沟通无果或工厂拒绝协商，劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
保留证据维权：如遇工厂违反劳动法规定，劳动者应保留相关证据（如工作记录、加班通知、调休安排等），以便通过协商、投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等方式维护自身合法权益。
综上所述，工厂强制员工上周六日上班来调星期二休息的合法性需综合考虑工时制度、调休安排的协商与审批情况，以及调休的合理性。如有疑问或争议，建议直接向我咨询以获取准确法律意见。