当申请人（此处可理解为诉讼中的一方当事人，如原告或被告）不同意鉴定方案时，可采取以下措施来维护自身权益：

一、明确表达异议并申请重新鉴定

1. 提出书面异议：申请人应在收到鉴定方案或鉴定意见后，及时向法庭提交书面异议，详细阐述不同意的理由。这些理由可以包括鉴定程序的不合法性、鉴定人员的资质问题、鉴定方法的科学性存疑等。

2. 申请重新鉴定：若申请人认为原鉴定方案存在严重问题，导致鉴定结果不可信，可向法庭申请重新鉴定。申请时，需说明重新鉴定的理由，并由双方共同认可或法院指定的鉴定机构进行。重新鉴定有助于揭示案件真相，确保判决的公正性。

二、向司法行政机关投诉反映

若申请人发现鉴定机构或鉴定人员在鉴定过程中存在违法违纪行为，如收受贿赂、故意歪曲事实等，可向省级司法行政部门投诉。司法行政部门将对其违法行为进行调查和处理，从而使得原鉴定结论作废或鉴定机构主动撤销违法的鉴定结论。这一措施有助于维护司法鉴定的公正性和权威性。

三、主动搜集其他证据推翻鉴定结论

1. 收集反证：申请人可主动搜集其他证据，如物证、书证、证人证言等，以推翻原鉴定结论。这些证据应与案件事实紧密相关，且能够证明原鉴定结论的错误或不合理性。

2. 邀请专家辅助人出庭：在庭审阶段，申请人可邀请相关领域的专家辅助人出庭，对鉴定意见进行质证。专家辅助人可从专业角度揭示鉴定意见可能存在的问题，为法庭提供科学、客观的参考意见。

四、参与庭审质证并表达意见

1. 充分准备质证材料：在庭审前，申请人应充分准备质证材料，包括对鉴定意见的异议、重新鉴定的申请、其他证据等。这些材料应详细、具体，能够充分支持申请人的观点。

2. 积极参与庭审质证：在庭审阶段，申请人应积极参与质证，通过提问、辩论等方式揭示鉴定意见可能存在的问题。同时，申请人也可对对方提出的证据进行质证，以维护自身权益。

五、遵守法庭决定并寻求专业支持

1. 遵守法庭决定：无论申请人是否同意鉴定意见或鉴定方案，最终都需遵守法庭的决定。若法庭采纳了鉴定意见作为判决依据，申请人应按判决要求履行相应义务。

2. 寻求专业支持：在处理司法鉴定异议时，申请人可聘请律师或相关领域的专家提供帮助和咨询。他们可提供专业的法律意见和策略建议，有助于申请人更好地维护自身权益。

后续行动建议：

• 申请人应保留与鉴定相关的所有材料，包括鉴定方案、鉴定意见、书面异议、重新鉴定申请等，以备不时之需。
• 在处理司法鉴定异议时，申请人应保持冷静和理性，避免情绪化行为影响案件处理。
• 若申请人对法律程序或相关法律规定不熟悉，可及时向我咨询，我将提供专业的法律意见和帮助。