在交通事故责任已认定，但事故尚未处理完毕，且对方的三责险保额不足以覆盖全部赔偿的情况下，您可以按照以下步骤处理：
一、明确赔偿顺序与责任
交强险优先赔付：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，首先由保险公司在机动车第三者责任强制保险（交强险）责任限额范围内予以赔偿。交强险的赔偿限额通常包括死亡伤残赔偿限额、医疗费用赔偿限额和财产损失赔偿限额。
三责险补充赔付：
- 若交强险赔付后仍有不足，且对方车辆购买了第三者责任险（三责险），则由三责险在保险限额内继续赔付。但在此案例中，三责险保额可能不足以覆盖全部赔偿。
责任方个人承担：
- 当交强险和三责险的赔付总额仍不足以覆盖全部损失时，剩余部分应由事故责任方（即对方）根据其责任比例个人承担。
二、处理流程与建议
及时与对方及保险公司沟通：
- 告知对方及其保险公司三责险保额不足的情况，要求对方尽快筹集资金以弥补差额。
- 同时，向自己的保险公司报案，并了解是否可以通过车损险等险种获得部分赔偿（如果适用）。
协商赔偿方案：
- 尝试与对方协商一个双方都能接受的赔偿方案，如分期付款、提供担保等。
- 若协商无果，可以考虑通过调解组织进行调解，以达成和解协议。
准备法律诉讼：
- 如果协商和调解均无法解决问题，您有权向人民法院提起民事诉讼，要求对方赔偿剩余损失。
- 在诉讼过程中，您需要提供事故认定书、损失清单、医疗费用发票等相关证据，以支持您的赔偿请求。
申请财产保全（如适用）：
- 如果您担心对方在诉讼过程中转移财产，导致判决后无法执行，可以向法院申请财产保全措施，冻结对方的银行账户、房产等财产。
三、注意事项与风险提示
保留证据：
- 确保妥善保管所有与事故相关的证据，包括事故认定书、现场照片、医疗记录、费用发票等。这些证据将在后续的协商、调解或诉讼过程中发挥关键作用。
注意诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。因此，您需要在法定的诉讼时效期间内提起诉讼，否则将可能丧失胜诉权。
考虑执行难度：
- 即使您获得了法院的判决，如果对方没有足够的财产可供执行，您也可能面临执行难的问题。因此，在提起诉讼前，您需要对对方的财产状况进行一定的了解。
总结来说，在对方三责险保额不足的情况下，您应首先通过交强险和三责险获得部分赔偿，然后与对方协商剩余赔偿方案。若协商无果，可以通过调解或诉讼途径解决纠纷。在整个过程中，务必保留好相关证据，并注意诉讼时效和执行难度的问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。