公司发了清算通知后，员工提起劳动仲裁的，公司应积极应对仲裁程序，并依法承担相应的责任。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、公司清算与员工权益
清算程序中的员工权益保护：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关劳动法律法规，公司在清算过程中应当妥善处理与员工的劳动关系，包括支付欠付的工资、经济补偿金等。
- 如果公司未依法支付员工应得的权益，员工有权通过劳动仲裁等法律途径维护自己的合法权益。
清算组的责任：
- 清算组在清算过程中负有清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、通知债权人等职责。
- 如果清算组未依法履行职责，导致员工权益受损，清算组成员可能需要承担相应的法律责任。
二、员工提起劳动仲裁的应对
积极应诉：
- 公司收到劳动仲裁通知后，应积极准备应诉材料，包括但不限于公司清算的相关文件、员工工资支付记录、经济补偿金计算依据等。
- 公司可以委托专业律师代理应诉，以确保在仲裁程序中充分维护自己的合法权益。
协商解决：
- 在仲裁程序进行过程中，公司也可以与员工进行协商，尝试达成和解协议。
- 如果双方能够就欠付的工资、经济补偿金等事项达成一致，可以签订和解协议并撤回仲裁申请。
三、可能的法律后果
仲裁裁决：
- 如果仲裁庭认为公司确实存在欠付员工工资、经济补偿金等违法行为，可能会裁决公司支付相应的款项。
- 公司应依法履行仲裁裁决，否则员工可以向人民法院申请强制执行。
法律责任：
- 如果公司未依法进行清算或未妥善处理员工劳动关系，导致员工权益受损，除了需要支付欠付的款项外，还可能面临行政处罚或刑事责任。
- 例如，根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司清算时隐匿财产、对资产负债表或者财产清单作虚伪记载或者在未清偿债务前分配公司财产的，由公司登记机关责令改正，对公司处以罚款；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员处以罚款并可能承担刑事责任。
四、建议与措施
完善清算程序：
- 公司应依法进行清算，确保清算程序的合法性和透明度。
- 清算组应认真履行职责，及时通知债权人并妥善处理员工劳动关系等事项。
加强法律意识：
- 公司应加强对劳动法律法规的学习和了解，确保在清算过程中不违反相关法律规定。
- 公司可以定期组织法律培训或咨询专业律师，以提高自身的法律意识和风险防范能力。
及时沟通与协商：
- 在清算过程中，公司应与员工保持及时沟通，了解员工的需求和关切。
- 如果出现争议或纠纷，公司应积极与员工进行协商，尝试达成和解协议以避免不必要的法律纠纷。
如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。