重新签署的租赁协议合同总期限超过二十年，超过部分是无效的，但不影响二十年内部分的效力。以下是对此问题的详细分析：

法律规定

根据《中华人民共和国民法典》第七百零五条：“租赁期限不得超过二十年。超过二十年的，超过部分无效。租赁期限届满，当事人可以续订租赁合同；但是，约定的租赁期限自续订之日起不得超过二十年。”这一规定明确了租赁合同的最长期限限制，旨在维护租赁市场的正常秩序和交易安全。

合同效力划分

1. 二十年内部分有效：

   • 若租赁合同期限超过二十年，但双方已实际履行了二十年以内的租赁期限，则这部分租赁关系是受法律保护的。双方需按合同约定履行义务，如支付租金、合理使用租赁物等。

2. 超过部分无效：

   • 超出二十年的部分则不具有法律效力，不受法律保护。这意味着，如果租赁合同约定了超过二十年的期限，超出部分将不会被法院认可或执行。

租赁期限届满后的处理

• 当二十年的租赁期限届满时，若双方希望继续维持租赁关系，可协商续订租赁合同。但需注意的是，续订后的租赁期限自续订之日起亦不得超过二十年。

实际操作建议

1. 合理确定租赁期限：

   • 在签订租赁合同时，双方应严格遵守法律规定，合理确定租赁期限，以避免不必要的法律风险和纠纷。不要试图通过约定过长的租赁期限来规避法律风险或不合理限制租赁物的使用、处分权利。

2. 协商解决争议：

   • 如双方在合同中已约定超过二十年的租赁期限，虽然超出部分无效，但双方仍可通过协商解决因此产生的争议。例如，可以协商调整租赁期限、租金等条款，以达成新的合法有效的租赁合同。

3. 寻求法律帮助：

   • 如果在签订或履行租赁合同过程中遇到法律问题或纠纷，建议及时咨询专业律师（如我本人）以获取法律帮助和指导。

举例说明：假设甲将房屋租给乙，双方重新签署租赁协议约定租赁期限为三十年。那么，根据法律规定，其中的二十年租赁期限是有效的，双方需按合同约定履行义务；而超出的十年部分则不具有法律效力。二十年后，双方可再协商是否续租及续租条件等事宜。

综上所述，重新签署的租赁协议合同总期限超过二十年时，超过部分是无效的。在签订和续订租赁合同时，务必确保遵守《民法典》关于租赁期限的相关规定，以保障合同的合法性和有效性。如有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。