结论前置：入编手续缺失是否影响退休，需结合具体情况判断，主要分以下两种情形：

1. 若缺失关键入编材料（如编制卡、审批文件等），但存在事实劳动关系
   根据《事业单位人事管理条例》及社保政策，退休的核心条件是达到法定退休年龄+累计缴费年限（含视同缴费年限）。若劳动者能通过工资发放记录、社保缴纳记录、工作证等材料证明与单位存在事实人事关系，即使入编手续不完整，仍可主张退休权益。但需注意：

   • 需补正编制材料（如联系单位或人社部门补办审批手续）；
     
   • 若因手续缺失导致社保缴费记录中断，可能影响养老金计算，需通过行政诉讼或仲裁确认工龄。

2. 若完全无入编证据，且未缴纳社保
   若劳动者无法证明与单位存在人事关系（如无工资记录、无社保缴纳），则可能被认定为“非在编人员”，此时：

   • 若以“临时工”身份工作，需按劳动合同法主张经济补偿，但无法享受事业单位退休待遇；
     
   • 若单位存在故意隐瞒编制、未缴纳社保等违法行为，可主张单位补缴社保并赔偿损失，但需通过劳动仲裁或诉讼解决。

关键建议：

• 立即收集能证明劳动关系的材料（如工资条、考勤记录、工作证等）；
  
• 联系单位人事部门或当地人社局，要求补办入编手续或出具工龄证明；
  
• 若单位拒绝配合，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，确认劳动关系及工龄。
  

法律依据：

• 《事业单位人事管理条例》第13条（入编审批程序）；
  
• 《社会保险法》第16条（退休条件）；
  
• 《劳动争议调解仲裁法》第2条（劳动争议范围）。
  

如有进一步细节（如具体缺失材料、单位态度等），可直接向我说明，我会为您细化分析。