针对您提出的“员工因自身疾病不能上班的赔偿标准”这一问题，我将结合相关法律法规，为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，员工因自身疾病不能上班时，其赔偿或补偿标准主要依据《中华人民共和国劳动合同法》以及相关的实施条例或地方性法规来确定。具体来说，这涉及到员工在医疗期内的权益保护以及医疗期满后的劳动关系处理。

一、医疗期内的权益保护

在医疗期内，员工享有病假工资、疾病救济费和医疗待遇等权益。根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及部分地方性法规（如《广东省工资支付条例》），员工在医疗期内，用人单位应当按照劳动合同、集体合同的约定或者国家有关规定支付病伤假期工资，且不得低于当地最低工资标准的百分之八十。

二、医疗期满后的劳动关系处理

1. 合法解除劳动合同的情形：

   • 当员工在医疗期满后，仍然无法胜任原工作岗位，也无法适应由用人单位另行安排的工作任务时，用人单位有权依法解除与其的劳动关系。
   • 在此种情况下，用人单位应根据员工在本单位的实际工作年限给予相应的经济补偿。具体标准为：每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。这里的月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。

2. 非法解除劳动合同的情形：

   • 如果员工并不符合上述合法解除劳动合同的情形，却仍然遭到用人单位的解雇，那么这种行为就构成了非法解除劳动合同。
   • 在此种情况下，用人单位不仅需要按照合法解除的标准向员工支付经济补偿，还需额外支付等额的经济赔偿金，即双倍的经济补偿。

三、特殊情况的考虑

• 对于被鉴定为丧失大部分劳动能力的员工，如果单位无合适的岗位为其安排工作，且员工在医疗期满后仍然无法从事原工作或另行安排的工作，那么单位可以依法解除劳动合同，但同样需要支付相应的经济补偿。
• 如果员工被鉴定为一至四级劳动能力障碍，应当退出劳动岗位，终止劳动关系，并办理退休、退职手续，享受相应的退休、退职待遇。

综上所述，员工因自身疾病不能上班时的赔偿标准主要依据其医疗期内的权益保护以及医疗期满后的劳动关系处理情况来确定。在处理此类问题时，建议用人单位和员工都应充分了解并遵守相关法律法规，以确保双方的合法权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请咨询专业律师或相关劳动部门。