关于您提出的“公司迟到一分钟罚款50是否合法”的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来综合判断。以下是我为您详细分析的内容：
一、一般情况下的不合法性
首先，我们要明确的是，在我国，罚款属于行政处罚权，其实施主体一般为行政机关。企业并不具备法律赋予的罚款权力，因此，企业直接以罚款形式对迟到员工进行经济处罚，在缺乏明确法律依据的情况下，通常是不合法的。此外，《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》等劳动相关法律法规，也并未明确赋予用人单位对员工进行罚款的权利。
二、特殊情况下的合法性判断
然而，在特定条件下，公司关于迟到扣工资的制度可能被认定为合法。这主要取决于以下两个关键因素：
民主程序制定并公示：
- 用人单位在制定涉及劳动报酬、工作时间、休息休假等直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，应当经过职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 规章制度制定后，还需要进行公示或者告知劳动者，确保员工知晓并理解相关内容。常见的公示方式包括在公司公告栏张贴、通过内部办公系统发布、组织员工培训学习并签字确认等。
- 如果公司关于迟到扣工资的制度是通过上述民主程序制定且已向员工公示，那么在程序上是合法的。
扣减工资合理性：
- 根据《工资支付暂行规定》，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但扣除的工资部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 对于迟到一分钟罚款50元的情况，我们需要考虑员工的工资水平以及迟到行为是否确实给公司造成了经济损失。如果员工月工资较高，且迟到行为确实对公司运营产生了一定影响，那么扣除50元作为惩戒可能被认为是合理的。但如果员工月工资较低，或者迟到行为并未对公司造成明显经济损失，那么这种高额的扣款就可能被视为不合理。
三、劳动者权益保护
如果您认为公司的迟到扣款行为侵犯了您的合法权益，您可以采取以下措施来维护自己的权益：
- 协商解决：首先尝试与公司进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
- 申请劳动仲裁：如果投诉未能解决问题，您还可以依法申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。
综上所述，公司迟到一分钟罚款50元的合法性并非绝对，而是需要根据具体情况进行综合判断。作为劳动者，您应该了解自己的权益，并在遇到相关问题时有理有据地维护自己的合法权益。