关于发包人与合同承包人签订的结算协议效力问题，这是一个涉及合同法和民事法律关系的重要议题。以下是对此问题的详细解答：
一、结算协议的一般效力
根据《民法典》的相关规定，民事主体按照自愿原则依法设立的民事法律关系，包括合同关系，受法律保护。因此，发包人与承包人之间签订的结算协议，如果双方意思表示真实，内容合法且不违背公序良俗，那么该协议就具有法律效力。这意味着，一旦协议成立并满足上述条件，双方就应当按照协议内容履行各自的义务。
二、影响结算协议效力的特定情形
尽管一般情况下结算协议是有效的，但在某些特定情形下，其效力可能会受到影响。这些情形包括但不限于：
欺诈、胁迫损害国家利益：如果一方通过欺诈或胁迫手段迫使对方签订结算协议，且该行为损害了国家利益，那么该协议可能被视为无效。
恶意串通损害他人利益：如果发包人和承包人双方恶意串通，以损害第三方利益为目的签订结算协议，那么该协议同样可能被视为无效。
以合法形式掩盖非法目的：如果结算协议表面上合法，但实际上是为了掩盖非法目的而签订的，那么该协议也可能被视为无效。
违反法规强制规定：如果结算协议的内容违反了法律、行政法规的强制性规定，那么该协议可能被视为无效。
重大误解、显失公平：如果结算协议存在重大误解或显失公平的情况，即一方在签订协议时处于信息劣势，导致所约定的结算金额对自己极为不利，那么受损害方有权申请撤销该协议。
三、实际案例分析
以小朱和小许的案例为例，小朱作为发包人认为结算协议存在重大误解且显失公平，而小许作为承包人则坚称协议是双方真实意思表示，内容合法。在这种情况下，如果小朱能够提供充分证据证明协议存在重大误解或显失公平，且经法院查证属实，那么小朱有权申请撤销该结算协议。
四、建议与总结
签订协议前应充分沟通：发包人和承包人在签订结算协议前，应充分沟通并明确各自的权利和义务，以避免因信息不对称或误解而导致的纠纷。
确保协议内容合法合规：双方应确保结算协议的内容符合法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
及时寻求法律救济：如果一方认为结算协议存在无效或可撤销的情形，应及时寻求法律救济，通过法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，发包人与合同承包人签订的结算协议在一般情况下是有效的，但在特定情形下其效力可能会受到影响。双方应严格遵守法律法规，确保协议内容的合法性和合规性，并在必要时及时寻求法律救济。