针对“拉没有检疫的牛怎么处罚司机”的问题，首先我们要明确的是，运输未经检疫的牛是违反《中华人民共和国动物防疫法》的行为。根据该法律的相关规定，对于此类违法行为，会有相应的处罚措施。

具体来说，如果司机运输了未经检疫的牛，那么根据《中华人民共和国动物防疫法》的第一百条第一款，对于屠宰、经营、运输的动物未附有检疫证明的，由县级以上地方人民政府农业农村主管部门责令改正，并处以罚款。罚款的金额会根据具体情况有所不同：

1. 对货主的处罚：处同类检疫合格动物、动物产品货值金额一倍以下罚款。
2. 对承运人（司机）的处罚：处运输费用三倍以上五倍以下罚款，如果情节严重，则处五倍以上十倍以下罚款。

以提供的两个案例为例：

• 在全州县农业农村局的行政处罚决定书中，当事人（货主）因运输未经检疫的母牛被罚款1.6万元，这是基于货值金额的0.05倍计算的。而该案例中的司机，虽然具体罚款金额未提及，但根据法律规定，他也会面临运输费用三倍以上五倍以下的罚款。
• 在陵水黎族自治县综合行政执法局的行政处罚决定书中，承运人郑亚史因运输未经检疫的黄牛被罚款货值金额的百分之十，即4100元。

综上所述，对于拉没有检疫的牛的司机，处罚措施主要是罚款，具体金额会根据运输的牛的货值金额或运输费用以及情节的严重程度来确定。同时，司机还可能被责令改正违法行为，并可能需要采取补救措施。因此，建议司机在运输牛只前，务必确保牛只已经过检疫，并持有有效的检疫证明，以避免不必要的法律风险和损失。