结论：付款给中介是否合法需分情况讨论，关键在于合同约定及资金流向是否符合法律规定。

1. 若合同明确约定通过中介代收款项，且中介具备合法资质
   根据《民法典》第九百六十一条，中介合同是中介人向委托人报告订立合同的机会或提供订立合同的媒介服务，委托人支付报酬的合同。若您与房东签订的租赁合同中明确约定“租金通过中介代收”，且中介已向您出示其合法经营资质（如营业执照、房地产经纪机构备案证明），则付款给中介的行为合法。
   需注意：中介代收后必须及时转付给房东，否则可能构成违约或侵占。您可要求中介提供转账凭证以留存证据。

2. 若合同未约定中介代收，或中介无合法资质
   若租赁合同中未明确中介代收条款，或中介未取得房地产经纪资质（根据《房地产经纪管理办法》，从事房地产经纪业务需备案），则您直接付款给中介可能存在风险：

   • 房东可能否认收款：若中介未将款项转交房东，房东有权以“未收到租金”为由解除合同或要求您再次支付。
     
   • 中介可能卷款跑路：无资质的中介缺乏监管，资金安全无保障。
     建议：此时应坚持按合同约定直接向房东付款，并要求房东开具发票。若中介强行要求代收，可拒绝并投诉至当地房管部门。

3. 关于发票的合法性要求
   根据《发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务的单位或个人应向付款方开具发票。因此：

   • 若房东是出租方，应由房东直接向您开具租金发票；
     
   • 若中介以“代开发票”名义收取费用，需核实其是否具备税务代理资质。若中介无法提供合法发票，可能涉及偷逃税款，您有权要求房东或中介补开发票，否则可向税务机关举报。

行动建议：

1. 立即核对租赁合同条款，确认是否有“中介代收”的约定；
   
2. 要求中介出示营业执照、房地产经纪备案证明及税务登记证；
   
3. 坚持“谁收款谁开发票”原则，避免通过无资质中介走账；
   
4. 若已付款给中介，务必保留转账记录、收据及沟通记录，以防纠纷。
   

如有进一步疑问，可直接向我提供合同条款或具体操作细节，我将为您分析风险点。