挂靠在运输公司的车大本给车主，一般不构成买卖国家机关公文罪。以下是对此问题的详细分析：
一、买卖国家机关公文罪的定义与构成要件
买卖国家机关公文罪，是指非法买卖国家机关公文的行为。该罪的构成要件主要包括：
- 客体要件：侵犯的是国家机关的正常管理活动和信誉。
- 客观要件：表现为非法买卖国家机关公文的行为。这里的“买卖”是指有偿转让或者有偿取得公文的行为。
- 主体要件：一般主体，即达到刑事责任年龄、具有刑事责任能力的自然人。
- 主观要件：故意，即明知是国家机关公文而进行买卖。
二、车大本的性质与归属
车大本，即机动车登记证书，是车辆所有权的法律证明，由车辆所有人持有。在挂靠关系中，虽然车辆可能挂靠在运输公司名下，但车辆的所有权通常仍归属于车主。因此，车大本作为车辆所有权的证明，其归属应明确为车主。
三、将车大本给车主的行为分析
- 行为性质：将车大本给车主，实际上是车主取回自己财产的所有权证明，这一行为本身并不涉及公文的买卖。
- 不构成买卖国家机关公文罪的理由：
- 无买卖行为：车主取回车大本，并非通过买卖方式获得，而是基于其车辆所有权的合法回归。
- 无故意：车主取回车大本，并非出于非法买卖的目的，而是为了证明自己对车辆的所有权。
- 无社会危害性：该行为并未对国家机关的正常管理活动和信誉造成侵害，因此不具有社会危害性。
四、可能涉及的法律风险与建议
虽然将车大本给车主一般不构成买卖国家机关公文罪，但在实际操作过程中，仍需注意以下几点以避免潜在的法律风险：
- 确保手续合法：在取回车大本的过程中，应确保所有手续合法、合规，避免因手续不全或违法而引发其他法律问题。
- 遵守挂靠协议：如果车主与运输公司之间存在挂靠协议，应仔细审查协议内容，确保取回车大本的行为不违反协议约定。
- 咨询专业律师：如果在取回车大本的过程中遇到任何法律问题或疑虑，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。