在政府采购合同履行过程中，供应商自愿少收费用并不直接构成违法，但需根据具体情况判断其合规性。以下从不同角度进行分析：

1. 合同变更的合法性

• 合同自愿原则：根据《民法典》的相关规定，合同双方在平等、自愿的基础上可以协商变更合同内容。若供应商与采购方就减少费用达成一致，且该变更不违反法律、行政法规的强制性规定，不损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益，则该变更具有法律效力。
• 程序合规性：在政府采购合同中，任何变更（包括费用减少）通常需遵循严格的程序，如报经相关部门批准或备案。若未履行必要程序，即使双方自愿，也可能因程序瑕疵而面临合规风险。

2. 政府采购的特殊性

• 公平竞争原则：政府采购需遵循公平、公正、公开的原则。若供应商自愿少收费用被视为不正当竞争手段（如以低价排挤其他供应商），则可能违反《政府采购法》的相关规定，面临行政处罚。
• 财政资金管理：政府采购合同涉及财政资金的使用，供应商自愿少收费用可能导致财政资金的不当节约或浪费，需确保符合财政资金管理的相关规定。

3. 可能的法律后果

• 合同效力：若变更程序合法且不违反强制性规定，合同变更有效，供应商需按变更后的内容履行义务。
• 行政责任：若变更行为违反政府采购程序或公平竞争原则，供应商可能面临行政处罚，如警告、罚款、列入不良行为记录名单等。
• 民事责任：若变更行为导致其他供应商损失，可能引发民事纠纷，供应商需承担相应的赔偿责任。

4. 建议与注意事项

• 书面协议：供应商与采购方应就费用减少事宜签订书面协议，明确变更内容、原因及双方权利义务，以避免后续纠纷。
• 程序合规：在政府采购合同中，任何变更均需遵循相关程序，如报经财政部门批准或备案，确保变更的合法性。
• 风险评估：供应商在自愿少收费用前，应充分评估可能面临的法律风险及后果，确保决策的合理性。

总结：政府采购合同履行过程中，供应商自愿少收费用并不直接违法，但需确保变更程序合法、不违反强制性规定及公平竞争原则。若存在疑问或不确定，建议供应商在决策前咨询专业律师，以规避潜在的法律风险。如有具体法律问题，可直接向我咨询。