医院科室主任无权乱扣奖金。奖金作为工资总额的组成部分，受到法律的严格保护，无论是在编人员还是合同工，其奖金都不应被无正当理由克扣。以下是对此问题的详细分析：
一、法律对工资和奖金的保护
根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬，且工资水平在经济发展的基础上逐步提高。国家对工资总量实行宏观调控，用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。但工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资，这里的工资自然包括了奖金部分。
二、医院科室主任无权扣奖金的原因
法律权限限制：医院科室主任作为医院的管理人员，其职责是管理和组织科室的工作，而非决定员工的工资和奖金分配。工资和奖金的分配通常由医院的人事部门或财务部门根据医院的规章制度和员工的绩效表现来决定。
违反劳动法规定：如果医院科室主任擅自扣减员工的奖金，这很可能构成对劳动法的违反。员工有权要求医院按照法律规定支付其应得的工资和奖金，如果医院拒绝支付，员工可以向劳动行政部门举报，维护自己的合法权益。
三、员工应如何应对
与医院沟通：如果员工发现自己的奖金被无故扣减，首先可以尝试与医院的人事部门或财务部门进行沟通，了解扣减的原因，并要求医院按照法律规定支付应得的奖金。
向劳动行政部门举报：如果与医院沟通无果，员工可以向当地的劳动行政部门举报医院的违法行为。劳动行政部门会对此进行调查，并根据调查结果采取相应的措施。
寻求法律援助：如果员工认为自己的权益受到了严重侵害，还可以寻求法律援助，通过法律途径来维护自己的合法权益。
四、可能的法律后果
如果医院或医院科室主任擅自扣减员工的奖金，且情节严重，可能会面临劳动行政部门的处罚，包括但不限于罚款、责令改正等。同时，员工还有权要求医院支付因扣减奖金而造成的经济损失和精神损害赔偿。
建议：作为员工，应当了解自己的权益和法律保护，如果发现自己的奖金被无故扣减，应当及时采取措施来维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。