针对您提出的环境污染罪中鉴定报告由环境局委托做出而非公安机关委托是否合法的问题，以下是我的详细解答：
鉴定报告的委托主体：
- 在环境污染罪的案件中，鉴定报告的委托主体并不局限于公安机关。环境局作为环境保护的主管部门，在发现环境污染行为或接到相关举报后，有权委托有资质的鉴定机构进行环境损害鉴定。这种委托行为是合法的，也是环境局履行其监管职责的一种方式。
鉴定报告的法律效力：
- 无论是由环境局还是公安机关委托做出的鉴定报告，只要其鉴定程序合法、鉴定机构有资质、鉴定方法科学，且鉴定结论与案件事实相关联，那么该鉴定报告就具有法律效力，可以作为认定环境污染罪的证据之一。
公安机关与环境局的协作：
- 在处理环境污染罪案件时，公安机关与环境局应当加强协作与配合。环境局在发现环境污染行为后，可以及时向公安机关通报，并协助公安机关进行调查取证。同时，公安机关在侦查过程中也可以要求环境局提供相关的环境损害鉴定报告或其他证据材料。
对鉴定报告的审查与质证：
- 在法庭审理过程中，无论是环境局还是公安机关委托做出的鉴定报告，都需要经过法庭的审查与质证。双方当事人可以对鉴定报告的合法性、真实性、关联性提出异议，并要求鉴定人出庭作证或接受询问。法庭将根据双方当事人的质证意见和鉴定报告的实际情况，决定是否采纳该鉴定报告作为认定案件事实的依据。
综上所述，环境污染罪中鉴定报告由环境局委托做出而非公安机关委托是合法的。关键在于鉴定报告的鉴定程序是否合法、鉴定机构是否有资质、鉴定方法是否科学以及鉴定结论是否与案件事实相关联。如果您在处理环境污染罪案件时遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。