因公死亡赔偿的负责部门主要取决于死亡人员的身份和工作性质，以下从不同角度进行分析：

1. 国家机关工作人员因公死亡：

   • 根据《民政部关于国家机关工作人员伤亡抚恤工作有关问题的通知》(民函〔2014〕343号)精神，国家机关工作人员因公牺牲的确认，由其所在单位或地区参照《军人抚恤优待条例》的有关规定办理。
   • 国家机关工作人员死亡一次性抚恤金标准、发放办法则按照民政部、财政部等相关部门发布的通知执行，如《关于调整一次性抚恤金发放办法的通知》(民发〔2001〕317号)等。
   • 负责部门：虽然具体抚恤金的发放可能涉及多个部门，但确认因公牺牲及初步处理通常由所在单位或地区负责，后续抚恤金发放等事宜则可能由民政部门、财政部门等相关部门协同处理。不过，从用户询问的“负责部门”角度来看，可以认为主要涉及的是所在单位及后续处理中的民政等相关部门。

2. 企业职工因公死亡：

   • 企业职工因公死亡，通常属于工伤范畴，应按照《工伤保险条例》等相关法律法规进行处理。
   • 负责部门：企业职工因公死亡的赔偿，主要由企业所在地的社会保险行政部门（如人力资源和社会保障局）负责工伤认定，并由工伤保险基金支付相应的工伤赔偿。若企业未参加工伤保险，则由企业自行承担赔偿责任。

3. 其他特定行业或身份人员因公死亡：

   • 对于其他特定行业或身份的人员（如军人、警察等），因公死亡的赔偿和抚恤通常由其所在行业的专门部门负责，如军队的退役军人事务部门、警察的公安部门等。

总结与建议：

• 因公死亡赔偿的负责部门并非单一，而是根据死亡人员的身份和工作性质而定。
• 对于国家机关工作人员，主要涉及所在单位及后续处理中的民政等相关部门。
• 对于企业职工，主要由社会保险行政部门负责工伤认定，并由工伤保险基金支付赔偿。
• 对于其他特定行业或身份的人员，则由其所在行业的专门部门负责。

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