针对您提出的问题，即“原告起诉确认合同有效，被告答辩合同有效，法院会如何处理”，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

一、确认合同有效诉讼的性质与条件

确认合同有效诉讼，本质上是一种防御性诉讼。它通常发生在当事人对合同效力产生争议，或者合同效力受到现实的挑战而处于不确定状态时。在这种情况下，一方或双方当事人可能会选择向法院提起诉讼，请求法院确认合同的效力。然而，如果双方对合同效力均无异议，且合同已经处于正常履行状态，那么提起此类诉讼可能就不具备诉的利益。

二、本案的具体情况分析

在您所描述的案例中，原告起诉确认合同有效，而被告答辩称合同有效。这表明双方对合同的效力均无异议，且合同已经在实际履行中。根据司法的功能在于定分止争的原则，只有当存在争议时，司法才有介入的必要。在本案中，由于双方对合同效力均认可，且合同处于正常履行状态，因此不存在法院介入的前提条件。

三、法院的处理方式

基于上述分析，法院在处理此类案件时，通常会认为原告的起诉不具备诉的利益，因此不属于人民法院受理民事诉讼的范围。法院可能会驳回原告的起诉，或者告知原告其起诉不符合受理条件。这是因为，在双方对合同效力均无异议的情况下，通过诉讼来确认合同效力并没有实际意义，反而可能浪费司法资源。

四、相关法律依据

这一处理方式也符合《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定。根据该法第一百二十二条，起诉必须符合下列条件：…（四）属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。在本案中，由于原告的起诉不具备诉的利益，因此不属于人民法院受理民事诉讼的范围。

五、建议与总结

对于当事人来说，在提起诉讼前应该充分评估自己的诉求是否具备诉的利益。如果双方对合同效力均无异议，且合同已经在实际履行中，那么通过协商或其他非诉讼方式来解决可能更为高效和便捷。同时，当事人也应该了解相关法律规定，确保自己的起诉符合受理条件。

综上所述，法院在处理原告起诉确认合同有效、被告答辩合同有效的案件时，通常会认为原告的起诉不具备诉的利益，并驳回其起诉或告知其起诉不符合受理条件。