员工在劳动仲裁中经济补偿主体错误，通常是可以更换被告并重新申请仲裁的。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 法律依据与原则：

   • 根据相关劳动法律法规，劳动仲裁应当基于正确的主体进行。如果原仲裁中的被告主体存在错误，导致裁决结果可能不公正或不符合实际情况，当事人有权通过合法途径进行纠正。
   • 劳动仲裁机构在审查重新申请时，会重点关注原裁决是否存在主体错误，并依法作出是否重新审理的决定。

2. 重新申请仲裁的流程：

   • 当事人可以在规定的时间内（通常为收到裁决书之日起的一定期限内，具体期限需参照当地劳动仲裁机构的规定），向有管辖权的劳动仲裁机构提出重新申请。
   • 在重新申请中，当事人需要明确说明原裁决存在主体错误的理由，并提供相关证据以支持其主张。

3. 重新申请仲裁的注意事项：

   • 当事人在提出重新申请时，应确保所提供的证据充分、确凿，能够证明原裁决中的被告主体确实存在错误。
   • 同时，当事人也应注意重新申请仲裁的时效性，避免因超过规定期限而丧失重新申请的权利。

4. 可能的法律后果：

   • 如果劳动仲裁机构认定原裁决确实存在主体错误，会依法重新进行审理和裁决。这样能保障当事人的合法权益，确保劳动仲裁的公正性和准确性。
   • 如果重新申请仲裁被驳回，当事人还可以考虑通过诉讼等途径进一步维护自己的权益。但在此之前，建议当事人充分评估诉讼的风险和成本，并咨询专业律师的意见。

综上所述，员工在劳动仲裁中经济补偿主体错误时，通常是可以更换被告并重新申请仲裁的。但在此过程中，当事人需要遵循相关法律法规和程序要求，确保自己的权益得到充分保障。如果您有进一步的法律问题或需要更具体的建议，请随时向我咨询。