如果员工申请的年休假刚好在周末，那一天通常不算加班。以下是对这一问题的详细分析：

1. 年休假的性质：

   • 年休假是员工根据工作年限和公司规定享有的带薪休假权利，旨在让员工得到休息和放松。
   • 年休假期间，员工不提供劳动，但公司仍需支付其正常工资。

2. 周末的性质：

   • 周末是法定的休息日，员工在周末通常不提供劳动，除非有特殊情况或公司安排。
   • 周末加班通常需要支付额外的加班费或安排补休。

3. 年休假与周末的重合：

   • 当员工申请的年休假与周末重合时，由于年休假本身已是带薪休假，且周末也是休息日，因此这一天通常不被视为加班。
   • 员工在年休假期间（包括与周末重合的部分）不提供劳动，公司也不需支付额外的加班费。

4. 特殊情况的处理：

   • 如果公司有特殊规定或与员工有特别约定，例如将周末纳入年休假计算范围但需支付额外费用或安排补休，则需按照公司规定或约定执行。
   • 但这种情况较为罕见，且通常会在劳动合同或公司规章制度中明确说明。

综上所述，如果员工申请的年休假刚好在周末，那一天通常不算加班。员工在年休假期间应享受正常的休息和放松，公司也无需支付额外的加班费。如有其他法律问题或需要进一步咨询，请随时向我提问。