针对您提出的“建设工程施工合同无效，但竣工验收合格怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

在建设工程施工合同被判定为无效，但工程已经竣工且验收合格的情况下，处理方式主要遵循以下几点原则：

1. 工程价款结算：

   • 承包商有权请求法院参照合同中约定的价格来支付工程价款。这是基于尊重当事人意思自治的原则，即便合同无效，关于工程价款的约定仍可作为结算的重要依据。
   • 若双方对工程价款没有约定或约定不明确，则可参照签订建设工程施工合同时当地建设行政主管部门发布的计价方法或计价标准来结算工程价款。
   • 在协商不成的情况下，承包商可向法院提起诉讼或依约定申请仲裁，通过司法或准司法程序来确定应得的工程款数额。此时，承包商需提供工程验收合格及相关工程量、工程价款计算依据等证据。

2. 损失承担：

   • 由于合同的无效性，可能会引发诸如工期延误、质量瑕疵等损失。对此，有过失的一方必须赔偿对方由此遭受的相应损失。
   • 若双方均存在过失，则应根据各自的过错程度来分担损失。这需要在法律框架内，根据实际过错比例来划分赔偿责任。

3. 工程质量保修责任：

   • 即便合同无效，但工程已经竣工验收合格，承包商仍可能需要承担保修义务。这是因为保修责任是基于工程质量合格这一事实而产生的，与合同的有效性无直接关联。
   • 保修责任的具体内容和期限应参照相关法律法规和行业标准来确定。

4. 法律途径与举证责任：

   • 在处理此类纠纷时，双方应首先尝试通过协商来解决争议。若协商不成，则可通过诉讼或仲裁等法律途径来寻求解决。
   • 在诉讼或仲裁过程中，双方均负有提供证据支持其主张的义务。证据种类包括当事人的陈述、书证、物证、视听资料、电子数据、证人证言、鉴定意见以及勘验笔录等。

综上所述，虽然建设工程施工合同被判定为无效，但只要工程已经竣工且验收合格，承包商仍有权请求参照合同约定支付工程价款，并承担相应的保修责任。同时，双方应根据各自的过错程度来分担因合同无效而产生的损失。在处理此类纠纷时，应遵循法律途径，并充分举证以支持其主张。