1. 关于一夜上两个班，每班6小时是否合法的问题：

   • 从劳动法的角度来看，劳动者每日工作时间一般不得超过8小时，每周工作时间不得超过44小时。如果用人单位安排劳动者加班，一般每日不得超过1小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过3小时，但是每月不得超过36小时。
   • 在您描述的情况下，一夜上两个班，每班6小时，总共12小时，这明显超出了每日8小时的工作时间限制，也超出了每周44小时的工作时间限制（如果这种情况频繁发生）。因此，从劳动法的角度来看，这种工作安排是不合法的。

2. 关于是否有赔偿的问题：

   • 如果用人单位违反了劳动法关于工作时间的规定，劳动者有权要求用人单位支付加班费。加班费的具体计算方式根据加班的时间和类型（如工作日加班、休息日加班、法定节假日加班）而有所不同。
   • 在您的情况下，如果用人单位经常安排您一夜上两个班，且未支付相应的加班费，那么您有权要求用人单位支付加班费作为赔偿。
   • 此外，如果这种超时工作对您的身体健康造成了损害，您还可以考虑要求用人单位承担相应的医疗费用和其他赔偿责任。但需要注意的是，要证明超时工作与身体健康损害之间的因果关系可能比较困难，需要专业的医疗鉴定和法律程序。

3. 建议与行动：

   • 首先，您可以与用人单位进行沟通，明确表达您对工作时间安排的不满，并要求用人单位支付加班费。
   • 如果沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉，要求他们介入调查并处理用人单位的违法行为。
   • 同时，您也可以考虑咨询专业的劳动法律师，了解您的具体权益和可能的法律途径。

综上所述，一夜上两个班，每班6小时的工作安排是不合法的，您有权要求用人单位支付加班费作为赔偿。如果用人单位拒绝支付或您对处理结果不满意，您可以考虑向劳动监察部门投诉或咨询专业的劳动法律师。如果您有任何进一步的法律问题或需要更详细的建议，请随时向我咨询。