公司培训签培训协议中的违约金在一定条件下是合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、违约金的合法性基础
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金。这一规定为培训合同中设置违约金条款提供了法律依据。然而，违约金的约定并非毫无限制，其数额和适用条件必须符合法律规定和公平原则。
二、培训协议中违约金合法性的具体判断标准
双方自愿签署：违约金条款必须是公司和员工在平等、自愿的基础上达成的合意。如果一方在签订合同时受到欺诈、胁迫等不正当手段的影响，该条款可能被视为无效。
违约金的合理性：违约金的数额应当与违约行为所造成的损失相适应，不得过分高于或低于实际损失。如果违约金过高，可能会被认为显失公平，法院或仲裁机构有权根据实际情况进行调整。
法律法规的遵守：培训合同中的违约金条款必须符合相关法律法规的规定，不得违反法律强制性规定或公序良俗。
三、培训协议中违约金的常见情形
服务期未满的违约金：如果公司为员工提供专项培训费用并对其进行专业技术培训，可以与员工订立协议约定服务期。若员工违反服务期约定，应当按照约定向公司支付违约金，但违约金的数额不得超过公司提供的培训费用，且不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。
无故不参加培训的违约金：如果员工无故不参加培训，导致公司遭受损失，公司有权根据合同约定要求员工支付违约金，但违约金的数额应当与实际损失相适应。
四、实际案例与法律建议
在实际操作中，培训协议中的违约金条款应谨慎设定，确保其合法性和合理性。公司应确保培训协议的内容符合法律法规的要求，并在签订前与员工进行充分沟通，确保双方对协议内容无异议。
如果您在签订或执行培训协议过程中遇到任何问题，或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。我作为专业律师，将竭诚为您提供帮助。