迟到扣二百是否合法，取决于多个因素。以下是对此问题的详细分析：

1. 规章制度需合法有效：

   • 用人单位在制定涉及劳动者切身利益的规章制度时，应经过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。这一程序是确保规章制度合法有效的关键。
   • 规章制度必须向劳动者公示或告知，未公示的规章制度不能作为处罚依据。

2. 扣款金额需合理：

   • 扣款金额应与劳动者的过错程度相适应，不得畸高。例如，若劳动者月工资为3000元，因一次迟到被扣除200元，可能被视为不合理的高额罚款，除非用人单位能证明其因劳动者迟到产生了相应的高额损失。
   • 扣款金额不应超过用人单位因劳动者迟到所遭受的实际经济损失。

3. 需与劳动者协商一致：

   • 若用人单位在劳动合同中明确规定了迟到扣款的数额和条件，且该规定不违反法律法规的强制性规定，劳动者也签字确认，则该条款具有法律效力。
   • 即使劳动合同中未明确规定，若用人单位在事后与劳动者就迟到扣款事宜达成一致，并签订书面协议，该协议也具有法律效力。

4. 特殊情况下的合法性分析：

   • 不同地区的劳动法规可能存在差异，部分地区可能对用人单位的罚款权有更为严格的规定。因此，在具体案件中，还需结合当地劳动法规进行判断。
   • 扣款后劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。若扣款导致劳动者工资低于最低工资标准，则扣款行为违法。

综上所述，迟到扣二百是否合法，需要综合考虑用人单位的规章制度是否合法有效、扣款金额是否合理、是否与劳动者协商一致以及是否存在特殊情况。若用人单位的扣款行为不符合上述任一条件，则可能构成违法。如有疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。