关于公司一次性交两个月社保是否合法的问题，这需要根据具体情况来分析。

首先，从一般原则上来看，企业按照规定的社保缴纳周期（通常是每月）进行社保费用的缴纳是符合法律法规的。然而，在实际操作中，可能会存在一些特殊情况，导致企业需要一次性缴纳两个月的社保。

以下是一些可能的情况及其合法性分析：

1. 因财务流程或系统故障导致的集中补缴：

   • 如果由于企业的财务流程变化或社保缴纳系统出现故障，导致无法按月正常缴纳，而需要集中补缴两个月的社保，那么在得到社会保障机构批准的情况下，这种补缴行为是合法的。

2. 蓄意长期拖欠后的集中缴纳：

   • 如果企业蓄意长期拖欠社保费用，积累多个月后再进行一次性缴纳，这种行为则可能被视为违规，并可能受到社会保障机构的惩罚。因为这种行为违背了社保缴纳的及时性和连续性原则。

3. 离职后的一次性扣除：

   • 对于离职员工，如果公司在其离职后一次性扣除两个月的社保费用，这通常是不合理的。根据《社会保险法》的规定，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。员工离职当月与用人单位仍存在劳动关系，单位应为其缴纳当月社保，从次月起停止缴纳。因此，公司不应在离职后一次性扣除两个月的社保费用，除非有特殊的书面约定或操作失误等情况。

总结与建议：

• 企业应严格按照规定的社保缴纳周期进行缴纳，确保社保费用的及时性和连续性。
• 如遇特殊情况需集中补缴或调整缴纳周期，应及时与社会保障机构沟通并获得批准。
• 对于离职员工，公司应严格按照法律法规处理社保缴纳问题，避免不合理扣除或拖欠。
• 如员工对公司的社保缴纳行为有异议，可通过合法途径进行维权，如与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等。