被核查人不交代但是证人证实了的线索不可以简单地以事实不清予以了结。

在行政调查或司法程序中，对于被核查人不交代但证人已证实的线索，不能仅凭被核查人的不交代就轻易作出事实不清的结论。以下是对此问题的详细分析：

1. 证人证言的效力：

   • 证人证言是证据的一种，如果证人证言能够与其他证据相互印证，形成完整的证据链，那么其证明力是相对较强的。
   • 即便被核查人不交代，只要证人证言真实、可靠，且与其他证据相符，就可以作为认定事实的依据。

2. 调查程序的完整性：

   • 行政调查或司法程序需要遵循一定的程序和规则，包括收集证据、询问当事人、调查事实等。
   • 如果仅因为被核查人不交代就了结案件，可能会违反程序正义，导致事实认定不清或错误。

3. 法律责任的追究：

   • 如果被核查人涉嫌违法或犯罪，即便其不交代，只要证据确凿，依然可以依法追究其法律责任。
   • 事实不清并不能作为免除法律责任的借口。

4. 后续处理建议：

   • 对于被核查人不交代但证人已证实的线索，应继续深入调查，收集更多证据，以形成完整的证据链。
   • 如果证据确凿，应依法作出处理决定；如果证据不足，也应依法作出相应说明或结论。

综上所述，被核查人不交代但证人已证实的线索不能简单地以事实不清予以了结。而应继续深入调查，根据证据情况依法作出处理决定。如果你对此类问题有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。