当员工在公司受伤时，单位应当按照以下步骤进行处理：

一、立即救治

1. 尽早送医：首先，应尽快将受伤员工送往工伤保险协议医疗机构进行救治。如果伤情危急，可以送往就近的医疗机构进行抢救，待伤情稳定后，再及时转入协议医疗机构进行治疗。
2. 异地就医：如果员工在参保地以外发生工伤，应优先选择事故发生地的工伤保险协议机构进行治疗。同时，用人单位应及时向参保地经办机构办理异地就医备案，并待伤情稳定后转回参保地工伤保险协议机构继续治疗。

二、及时报案与工伤认定

1. 报案：用人单位应在事故发生后及时报案。对于上下班途中的交通事故，或者其他原因造成的重伤事故、死亡事故，用人单位应当于事故发生后24小时内报告。对于其他原因造成的轻伤事故和职业病，用人单位应当于事故发生后或者接到职业病诊断书3日内报告。
2. 工伤认定申请：用人单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。申请时应填写《工伤认定申请表》，并提交相关材料，如劳动、聘用合同文本复印件、医疗机构出具的受伤后诊断证明书或职业病诊断证明书等。

三、后续处理

1. 劳动能力鉴定：如果员工伤情严重，待病情稳定后，用人单位应为其申请劳动能力鉴定。
2. 工伤待遇申请：用人单位应当自收到劳动能力鉴定结论书之日起30日内，持工伤认定决定书和劳动能力鉴定结论书及相关资料，到经办机构为职工办理工伤保险待遇申报手续。

四、注意事项

1. 配合调查：在工伤认定过程中，社会保险行政部门可能会进行调查核实。用人单位应积极配合，提供相关资料和证据。
2. 保密义务：社会保险行政部门工作人员在调查核实时，会保守有关单位商业秘密以及个人隐私。用人单位也应尊重并保护员工的隐私权。

综上所述，员工在公司受伤后，单位应立即进行救治、及时报案与申请工伤认定，并按照后续处理流程为员工办理相关手续。在整个过程中，单位应积极配合相关部门的调查和工作，确保员工的合法权益得到保障。