企业起诉合作公司员工在某些情况下是有用的。具体来说：
维护合法权益：如果合作公司的员工在合作过程中存在违反合同、侵犯商业秘密、损害企业利益等行为，企业通过起诉可以追究其法律责任，维护自身的合法权益。例如，如果员工违反了竞业限制协议，企业可以通过起诉要求其承担违约责任，并防止进一步的利益损害。
促进合同履行：在合作过程中，如果合作公司的员工未按照合同约定履行义务，企业通过起诉可以强制其履行。这有助于确保合同的顺利执行，维护企业的正常经营秩序。
警示作用：起诉合作公司员工还可以起到警示作用，让其他员工意识到违反合同或法律行为的严重性，从而规范员工行为，减少类似纠纷的发生。
然而，起诉也需要考虑一些实际因素：
证据充分性：起诉前必须确保有足够的证据来支持企业的主张。如果没有充分的证据，可能无法获得胜诉判决。
成本和效率：起诉过程需要耗费一定的时间和成本，包括律师费、诉讼费等。企业需要权衡起诉的成本和可能获得的收益，以决定是否值得起诉。
法律关系复杂性：企业与合作公司员工之间的法律关系可能相对复杂，涉及合同、劳动法、商业秘密等多个方面。在起诉前，企业需要仔细梳理法律关系，确保起诉的合法性和有效性。
综上所述，企业起诉合作公司员工在维护合法权益、促进合同履行等方面是有用的，但也需要考虑证据充分性、成本和效率以及法律关系复杂性等因素。如果企业有此类问题，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。