针对“工作未完成被罚款是否合法”的问题，我们可以从法律性质、相关法律法规、合法管理与激励措施以及员工权益保护措施等方面进行详细分析。
一、罚款的法律性质与主体资格
罚款的法律定义：罚款通常被视为一种行政处罚手段，依据《中华人民共和国行政处罚法》，仅有行政机关具备作出罚款决定的权力。公司作为企业法人，并不具备这种行政权力。
公司无权罚款：根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，用人单位不得随意对员工进行罚款。除非在特定情况下（例如违反服务期约定或竞业限制），否则用人单位没有权利对员工实施经济处罚。
二、相关法律法规依据
劳动法保护：《中华人民共和国劳动法》等法律法规旨在保护劳动者的合法权益，确保劳动关系的公平合理。法律明确禁止用人单位无故克扣或拖欠劳动者工资，而罚款往往被视为一种克扣工资的行为。
劳动合同法的具体规定：《中华人民共和国劳动合同法》第二十五条明确指出，对于工作未完成的情形，用人单位通常没有权利对员工进行罚款。即使劳动合同中有相关约定，也可能因违反法律的强制性规定而无效。
三、合法的管理与激励措施
公司应当通过合法、合理的管理手段来激励和约束员工，以下是一些建议：
绩效管理：建立科学的绩效考核体系，将员工的工作表现与薪酬、晋升等挂钩，以激励员工积极完成任务。
培训与发展：提供必要的培训和发展机会，帮助员工提升技能和能力，从而更好地适应工作需求。
奖励机制：实施奖励机制，对表现优秀的员工进行表彰和奖励，营造积极向上的工作氛围。
内部规章制度：制定合法且经过民主程序的内部规章制度，对员工的失误或过错进行规范处理，如警告、记过等。这些处理措施应当合法、合理，并符合公司的规章制度。
四、特殊情况下的处理
如果员工未完成工作任务给公司造成了实际经济损失，公司可以要求员工赔偿。但这种赔偿应该通过合法、合理的途径进行，如与员工协商确定赔偿金额，并在合理范围内从工资中扣除。每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
五、员工权益保护措施
面对公司的不当罚款行为，员工可以采取以下措施维护自己的合法权益：
与公司沟通协商：首先尝试与公司管理层友好沟通，说明公司罚款行为的违法性，要求公司停止罚款并返还已扣款项。
向劳动监察部门投诉：若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对公司的违法行为进行调查和处理。
申请劳动仲裁：员工还可以收集相关证据，如劳动合同、工资条、罚款通知等，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付克扣的工资及可能的赔偿金。
综上所述，公司对员工未完成工作直接进行罚款是违法的。公司应当采取合法、合理的管理措施来激励和约束员工，同时保障员工的合法权益。员工在面对公司的不当罚款行为时，也应积极采取措施维护自己的合法权益。