关于“调解书案件受理费由被告负担，原告申请退费”的规定，以下是我根据相关法律知识和实践经验给出的详细解答：
结论前置
在调解书中，如果明确约定案件受理费由被告负担，且原告已经预先缴纳了该费用，那么原告有权向法院申请退费。退费的具体流程和时间可能因地区、法院的不同而有所差异，但通常遵循一定的程序。
退费流程
提交退费申请：
- 原告需要向法院递交退费申请，申请中应明确说明退费的原因（即调解书中约定案件受理费由被告负担）以及退费的金额。
- 同时，原告需要附上调解书等生效法律文书作为退费申请的依据。
法院审核：
- 法院收到退费申请后，会对申请及所附材料进行审核，确认原告是否确实无需承担案件受理费，以及退费金额是否正确。
退费程序启动：
- 如果审核通过，法院会启动退费程序，通过财务系统将款项退至原告提供的银行账户。
退费完成：
- 退费的时间可能因法院的工作流程和财务制度而有所不同，但通常会在申请提交后的一段特定期限内完成。
注意事项
- 材料齐全：原告在申请退费时，应确保所提交的材料齐全、准确，以免影响退费进度。
- 关注法院规定：不同法院在退费流程和要求方面可能有所不同，原告应关注受理法院的具体规定，并按要求办理退费事宜。
- 及时沟通：如果在退费过程中遇到问题或疑虑，原告应及时与法院沟通，寻求解决方案。
法律依据
- 根据相关法律规定，案件受理费的承担由败诉方负担，除非另有约定。在调解书中，如果双方明确约定案件受理费由被告负担，那么原告有权申请退费。
- 退费的具体流程和时间可能因地区、法院的不同而有所差异，但通常遵循法院内部的财务制度和退费程序。
综上所述，如果调解书中明确约定案件受理费由被告负担，且原告已经预先缴纳了该费用，那么原告可以按照上述流程向法院申请退费。在申请过程中，应确保材料齐全、准确，并关注受理法院的具体规定。如果有任何问题或疑虑，可以及时与我沟通或向法院咨询。