企业公积金缴存基数变更是合法的，但需要在符合相关规定的前提下进行。

首先，根据相关规定，单位及其职工住房公积金缴存基数为职工本人上一年度的月平均工资，这包含了职工上一年度的年终奖金。对于新参加工作的职工，如应届毕业生，其住房公积金缴存基数为参加工作第二个月的工资；对于新调入的职工，其缴存基数为调入单位发放工资当月的工资。该缴存基数的适用期间为整个住房公积金年度。

其次，住房公积金缴存基数有明确的上下限规定。它不得低于市人力资源和社会保障部门公布的上一年度月最低工资标准，同时也不得超过国家规定的缴存基数上限。这意味着，企业在调整公积金缴存基数时，必须确保新的基数在这个范围内。

此外，单位可根据自身的经营状况，并经过工会、职工代表大会或职工大会的讨论通过，按照公积金中心的相关规定调整单位和职工的住房公积金缴存比例。但需要注意的是，个人缴存比例不得低于单位缴存比例，且缴存比例的调整次数并不受限制。

最后，关于公积金缴存基数的调整频率，原则上在同一个单位每年（1月1日至12月31日）只能调整一次。单位可以在全年任意一个月份进行基数的调整，但如果因为调整基数导致职工当年少缴了公积金，单位需要同时为职工办理补缴手续。

综上所述，企业在符合相关规定的前提下，是可以变更公积金缴存基数的。如果企业对公积金缴存基数的调整存在疑问或不合规的情况，建议咨询当地的住房公积金管理中心或相关部门以获取更准确的指导和帮助。