公司因考核不合格少发工资的行为可能违法，具体需根据劳动合同和实际考核情况判断。

一. 劳动合同约定与考核标准

1. 劳动合同内容：首先，要查看劳动合同中是否有关于薪资、考核标准以及薪资调整的相关约定。根据《劳动合同法》第三十条，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
2. 考核标准明确性：考核标准应当明确、具体，且经过劳动者确认。如果考核标准模糊或未经劳动者同意，用人单位不能仅凭此标准扣减工资。

二. 工资扣减的合法性

1. 扣减依据：用人单位扣减工资必须有合法依据，如劳动合同约定、公司规章制度或国家法律法规。无合法依据的扣减行为可能构成克扣工资，违反《劳动法》第五十条。
2. 规章制度制定程序：如果公司依据规章制度扣减工资，该规章制度必须经过民主程序制定，且内容合法、合理，并已向劳动者公示或告知。

三. 实际考核情况

1. 考核过程公正性：考核过程应当公正、透明，确保劳动者的知情权和申诉权。如果考核过程存在不公或暗箱操作，劳动者有权提出异议。
2. 考核结果合理性：考核结果应当与劳动者的实际工作表现相符。如果考核结果明显不合理，劳动者可以请求重新考核或提出申诉。

四. 处理建议

1. 与用人单位沟通：首先，建议与用人单位进行沟通，了解扣减工资的具体原因和依据，并要求用人单位提供考核不合格的证据。
2. 申请劳动仲裁：如果沟通无果，劳动者可以向当地劳动人事争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求用人单位补足工资差额并赔偿损失。
3. 法律诉讼：对劳动仲裁结果不服的，劳动者还可以依法向人民法院提起诉讼。

我建议：劳动者在面临此类问题时，应首先查看劳动合同和考核标准，确保自己的权益不受侵害。如确实存在不合法扣减工资的情况，应勇敢维护自己的合法权益，通过沟通、仲裁或诉讼等途径寻求解决。如有进一步需要，您可以继续咨询我。