针对“员工孕期公司怎么合法处理”的问题，以下是一些详细且深度的解答：
一、劳动关系的维持与解除
不得随意解除：
- 根据《劳动合同法》第四十二条，女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得依照本法第四十条（非过错性解除）和第四十一条（经济性裁员）的规定解除劳动合同。这意味着，除非女职工存在过错，否则用人单位不能单方面解除劳动关系。
过错性解除：
- 尽管孕期女职工受到特殊保护，但如果她们严重违反公司规章制度或存在其他过错行为（如提供虚假病假条等），用人单位仍可以依据《劳动合同法》第三十九条的规定合法解除劳动关系。
二、劳动时间与劳动强度
调整劳动时间：
- 对于怀孕7个月以上的女职工，用人单位不得延长劳动时间或安排夜班劳动，并应在劳动时间内安排一定的休息时间。
产前检查：
- 怀孕女职工在劳动时间内进行产前检查，所需时间应计入劳动时间，即视为正常出勤。
调整劳动强度：
- 如果女职工在孕期不能适应原劳动，用人单位应根据医疗机构的证明，予以减轻劳动量或安排其他能够适应的劳动。
三、工资与福利待遇
保持不变：
- 用人单位不得因结婚、怀孕、产假、哺乳等情形，降低女职工的工资和福利待遇。
合同自动延续：
- 女职工在怀孕以及依法享受产假期间，如果劳动（聘用）合同或服务协议期满，合同或协议期限应自动延续至产假结束。但用人单位依法解除或女职工依法要求解除的除外。
四、其他保护措施
招录过程中的平等：
- 用人单位在招录过程中，不得实施限定为男性、规定男性优先、询问或调查女性求职者的婚育情况、将妊娠测试作为入职体检项目等行为。
特殊保护条款：
- 用人单位在录（聘）用女职工时，应依法签订包含女职工特殊保护条款的劳动（聘用）合同或服务协议，并不得规定限制女职工结婚、生育等内容。
反性骚扰：
- 在劳动场所，用人单位应预防和制止对女职工的性骚扰，确保女职工的工作环境安全、健康。
综上所述，公司在处理孕期员工时，应严格遵守相关法律法规，确保女职工的合法权益得到充分保护。同时，女职工也应自觉遵守公司规章制度，共同维护和谐的劳动关系。