事业单位和其全资企业共同办公并不直接构成违法行为。但是，这种办公模式是否合规，需要从多个角度进行具体分析：
法人独立性：事业单位和其全资企业在法律上通常是两个独立的法人实体。它们各自承担独立的法律责任，拥有独立的财产和权益。因此，从法人独立性的角度来看，两者共同办公并不直接违反法律规定。
财务管理：事业单位和其全资企业在财务管理上应当保持独立。如果两者在共同办公过程中，财务管理混同，如资金往来不清晰、账目不独立等，可能违反相关财务管理规定，甚至可能触犯法律。因此，在共同办公时，应确保财务管理的独立性和规范性。
业务运营：事业单位和其全资企业在业务运营上应各自独立。如果两者在共同办公中，业务运营混同，如业务范围不清晰、业务操作不规范等，可能引发业务纠纷，甚至可能违反相关法律法规。因此，在共同办公时，应明确各自的业务范围和运营规范。
人员配置：事业单位和其全资企业在人员配置上应各自独立。如果两者在共同办公中，人员配置混同，如人员职责不明确、人员管理不规范等，可能影响工作效率和人员积极性，甚至可能违反劳动法律法规。因此，在共同办公时，应确保人员配置的独立性和合理性。
综上所述，事业单位和其全资企业共同办公并不直接构成违法行为，但在实际操作中应注意保持法人独立性、财务管理的规范性、业务运营的清晰性以及人员配置的合理性。如有任何具体法律问题或疑虑，建议直接向我咨询，我将为你提供更详细的法律分析和建议。