公司加班时长超过法定限制，将会面临一系列的法律后果。以下是具体的分析：
法律警告与罚款：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关法规，用人单位违法延长员工工作时间的，由劳动行政部门给予警告，并责令改正。
- 同时，用人单位可能面临按照受侵害的劳动者每人100元以上16500元以下的标准处以罚款的法律风险。
特殊群体的额外保护：
- 对于怀孕七个月以上的女员工和正在哺乳未满一周岁婴儿的女员工，用人单位若违法安排其加班，将面临更严厉的罚款，即按照受侵害的劳动者每人1000元以上5000元以下的标准处以罚款。
规章制度违法的后果：
- 如果用人单位在规章制度中规定超过法定加班时长上限的加班时间，甚至对拒不服从加班安排的员工规定有惩戒措施，这可能因规章制度违反法律法规而被劳动行政部门给予警告或责令限期改正。
综上所述，公司应严格遵守劳动法关于加班时长的规定，以避免可能的法律风险。如果公司存在加班时长超过法定限制的情况，建议尽快调整，确保符合法律法规的要求。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。