企业不能仅凭员工只有打卡时间没有加班内容就起诉员工不当得利。下面我将从法律角度详细解释这一观点：

1. 不当得利的构成：

   • 不当得利是指没有法律根据，使他人受到损失而自己获得了利益。
   • 在劳动关系中，员工获得工资是基于劳动合同和劳动法的相关规定，而非无端的“不当得利”。

2. 加班与工资的关系：

   • 加班通常需要员工在法定工作时间外提供额外的劳动，且应经过用人单位的同意或安排。
   • 若员工仅是打卡而未实际提供加班劳动，这可能构成违反公司规章制度或劳动纪律的行为，但并不直接构成不当得利。

3. 企业的正确做法：

   • 企业应首先通过内部管理制度来规范员工的打卡和加班行为，如设置合理的加班审批流程、加强考勤管理等。
   • 若发现员工存在虚假打卡等违规行为，企业可以依据公司规章制度进行相应处理，如警告、罚款、解除劳动合同等。
   • 若因员工的违规行为给企业造成了经济损失，企业可以通过法律途径追究员工的赔偿责任，但这并非基于“不当得利”的诉由。

4. 法律建议：

   • 企业在处理员工打卡与加班问题时，应遵守劳动法律法规，确保员工的合法权益不受侵犯。
   • 若企业认为员工的某种行为构成了不当得利或其他违法行为，应及时咨询专业律师，以便采取正确的法律措施。

综上所述，企业不能仅凭员工只有打卡时间没有加班内容就起诉员工不当得利。企业应通过合法的管理手段来规范员工行为，并在必要时寻求法律帮助。