法院会综合考虑房产转让的合法性、钱款支付的事实以及是否存在其他争议等因素进行判决。

一. 房产转让的合法性分析

1. 所有权人处分权：根据《中华人民共和国民法典》第二百四十条，所有权人对自己的不动产依法享有占有、使用、收益和处分的权利。因此，如果儿子是房屋的所有权人，他有权将房屋出售给父亲。但在此案中，需确认儿子是否确实拥有房屋的所有权，或是否获得了父亲的明确授权进行出售。

2. 无权处分与善意取得：若儿子并非房屋的所有权人，也未获得父亲的授权，则其行为属于无权处分。然而，根据《中华人民共和国民法典》第三百一十一条，如果父亲作为受让人在受让房屋时是善意的，并且以合理的价格购买，且房屋已经依法登记在父亲名下，那么父亲可能取得房屋的所有权。但在此情况下，原所有权人（如房屋的实际所有权人为父亲或其他家庭成员）有权向儿子请求损害赔偿。

二. 钱款支付的事实

• 如果父亲已经按照合同约定支付了房款，这将作为转让行为已经完成的重要证据。法院在判决时会考虑这一事实，确认父亲已经履行了其主要合同义务。支付钱款的方式、时间以及是否有相关凭证等，都是法院在判断钱款支付事实时会考虑的因素。

三. 是否存在其他争议

1. 欺诈、胁迫等违法行为：如果存在儿子在出售房屋过程中存在欺诈、胁迫等违法行为，或者转让合同存在无效或可撤销的情形，法院将依据相关法律规定进行裁决。

2. 合同的有效性：法院还会审查房屋买卖合同的有效性，包括双方是否具有民事行为能力、意思表示是否真实一致等。

四. 公证的效力

• 公证作为法律证明的一种形式，可以增强转让行为的法律效力，但并非转让行为的必要条件。公证本身并不直接产生物权变动的效力，而是作为证据的一种，证明转让行为的真实性和合法性。

总结：

• 如果儿子是房屋的所有权人或获得了父亲的明确授权，且双方签订了有效的房屋买卖合同，父亲已经支付了房款，并且房屋已经依法登记在父亲名下，那么法院通常会确认转让行为的合法性，并保护父亲的合法权益。
• 如果儿子无权处分房屋，但父亲符合善意取得的条件，那么父亲可能取得房屋的所有权，而原所有权人可以向儿子请求损害赔偿。
• 如果存在其他争议或违法行为，法院将依据相关法律规定进行裁决。

我建议：在处理此类纠纷时，双方应提供充分的证据证明自己的主张，包括房屋所有权证明、买卖合同、付款凭证、公证文书等。如有进一步需要，您可以继续咨询我。