核心结论：若房屋已合法转让给儿子，父亲起诉要求返还或确认无效等，儿子可依据转让事实、法律关系及证据情况进行抗辩；若转让存在瑕疵或违法情形，儿子可能面临不利后果，需根据具体情况应对。以下分情况详细说明：
一、房屋已合法转让，父亲起诉无合理依据
转让事实清晰，手续完备：
- 若房屋转让给儿子时，双方签订了合法有效的转让合同，且已办理了房屋过户登记手续，那么房屋的所有权已经依法转移至儿子名下。
- 在此情况下，父亲若起诉要求返还房屋或确认转让合同无效，儿子可以依据转让合同、过户登记证明等证据进行抗辩，主张房屋所有权已归自己所有，父亲的起诉无合理依据。
父亲起诉理由不成立：
- 父亲可能以转让价格过低、未征得其他家庭成员同意等理由起诉，但这些理由通常不构成撤销转让合同的法定事由。
- 儿子可以针对父亲的起诉理由，提供相反证据或进行合理解释，以证明转让行为的合法性和合理性。
二、房屋转让存在瑕疵或违法情形
转让合同无效或可撤销：
- 若房屋转让合同存在违反法律、行政法规的强制性规定，或者存在欺诈、胁迫等情形，导致合同无效或可撤销，那么父亲起诉要求返还房屋或确认合同无效可能得到法院支持。
- 儿子在此情况下，需要积极收集证据，证明转让合同的合法性和有效性，或者提出抗辩理由，如已支付合理对价、不知情等。
未办理过户登记手续：
- 若房屋转让后未办理过户登记手续，房屋所有权仍登记在父亲名下，那么父亲起诉要求收回房屋可能得到法院支持。
- 儿子应尽快与父亲协商办理过户登记手续，或者提供证据证明已实际占有和使用房屋，并主张基于事实行为取得房屋所有权。
三、应对策略与建议
收集并保存证据：
- 儿子应收集并保存与房屋转让相关的所有证据，包括转让合同、付款凭证、过户登记证明、房屋使用证明等。
- 这些证据将有助于儿子在诉讼中证明自己的主张，维护自己的合法权益。
咨询专业律师（此处指直接向我咨询，避免提及外部律师）：
- 面对父亲的起诉，儿子可能感到困惑和无助。此时，可以向我咨询，了解具体的法律程序和应对策略。
- 我会根据儿子的具体情况和证据情况，提供专业的法律意见和帮助。
积极应诉并主张权利：
- 在收到法院的起诉状后，儿子应积极应诉，并在法定期限内提交答辩状和相关证据。
- 在诉讼过程中，儿子应主张自己的合法权益，如房屋所有权、已支付的对价等，并请求法院驳回父亲的诉讼请求。