总公司副总经理直接干预子公司事务是否合法，需根据具体情况分析。以下是对此问题的详细分析：

一. 总公司与子公司的法律关系

1. 子公司具有独立法人资格：根据《公司法》第十四条，子公司具有法人资格，依法独立承担民事责任。这意味着子公司有其独立的经营管理权和决策权。
2. 总公司对子公司的控制：虽然子公司独立，但总公司通常通过股权控制、董事会决策等方式对子公司进行管理和控制。这种控制应在法律和公司章程的框架内进行。

二. 副总经理的职权范围

1. 副总经理的职位与职责：副总经理在总公司中担任高级管理职务，其职权范围通常限于总公司内部事务。副总经理的职权应由公司章程或相关决议明确。
2. 对子公司事务的干预：副总经理直接干预子公司事务，可能涉及对子公司经营决策、人事安排、财务管理等方面的直接影响。这种干预是否合法，取决于其是否有总公司或子公司的明确授权，以及这种干预是否违反法律或公司章程。

三. 合法性分析

1. 有授权的情况：如果总公司明确授权副总经理可以代表总公司对子公司进行某些方面的管理或监督，且这种授权不违反法律或公司章程，那么副总经理的干预行为是合法的。
2. 无授权或违反规定的情况：如果副总经理没有获得总公司的明确授权，或者其干预行为违反了法律、公司章程或子公司的独立经营原则，那么这种干预行为是不合法的。

我的观点：总公司副总经理直接干预子公司事务的合法性，取决于其是否有明确的授权，以及这种干预行为是否符合法律和公司章程的规定。在没有明确授权或违反规定的情况下，副总经理的干预行为可能构成对子公司独立经营权的侵犯，是不合法的。因此，建议在实际操作中，总公司与子公司应明确各自的职权范围，确保经营管理活动的合法性和规范性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。