当股东违反合同或公司章程，公司考虑将其除名时，必须遵循一系列法定程序以确保公正、透明，并保护所有相关方的合法权益。以下是对这一流程的详细解答：

一、除名前的准备与调查

1. 公司章程审查：首先，公司应确认其章程中是否包含股东除名的相关条款和程序。这些条款应明确除名的条件、程序以及被除名股东的权利保障。

2. 事实调查：当发现股东有违反合同或章程的行为时，公司应启动内部调查程序，确保事实清楚、证据确凿。这包括收集相关证据、与涉事股东沟通等。

二、除名决议的作出

1. 催告程序：在确认股东违规行为后，公司应书面催告该股东，要求其在一定期限内改正或履行相关义务。这一步骤是除名程序中的重要环节，旨在给予股东改正的机会。

2. 召开股东会：若股东在催告期限内未改正或履行义务，公司应召开股东会，就除名事项进行表决。会议应确保所有股东的参与权，特别是被除名股东的申辩权利。

3. 决议通过：除名决议需经代表三分之二以上表决权的股东通过。在表决过程中，应严格遵守公司章程和公司法规定的表决程序。

三、除名通知与后续处理

1. 发出除名通知：决议通过后，公司应向被除名股东发出书面除名通知，明确告知其除名的决定及理由，并要求其在规定时间内办理相关手续，如股权转让等。

2. 股权处理：被除名股东的股权处理应遵循公司章程或股东会的决议。这可能包括由其他股东受让股权、公司回购股权或进行减资等操作。在处理过程中，应确保股权价值的合理评估，并遵循法定程序。

3. 变更登记：除名决议生效后，公司应及时办理工商变更登记等手续，去除被除名股东的相关信息。

四、法律救济途径

若被除名股东对除名决定不服，可通过法律途径寻求救济。这可能包括向法院提起诉讼或申请仲裁等。在法律程序未完结前，除名决定仍应执行，但公司应尊重法律判决并据此调整相关处理措施。

综上所述，股东违反合同除名是一项严肃的法律行为，必须遵循严格的法定程序。在整个过程中，公司应确保程序的公正性、透明性和合法性，以保护所有相关方的合法权益。