在处理合同纠纷案件中，如果一审法院认定合同无效，而二审法院认定合同有效，这通常涉及到对案件事实的重新审查、法律适用的重新评估以及二审程序的特定流程。以下是对这一情况的详细解答：
一、二审改判合同有效的依据
新证据的影响：
- 在二审期间，如果当事人提交了新证据，并且这些证据能够证明合同的有效性（如合同签署人的合法处分权、合同的实际履行情况等），二审法院可能会基于这些新证据改判合同有效。
一审事实认定错误：
- 如果一审法院在合同签订背景、当事人真实意思表示等关键事实上认定有误，二审法院在重新审查并核实后，会基于正确的事实判断合同效力，并可能因此改判合同有效。
法律适用的差异：
- 不同法官对同一法律条文的理解和解释可能存在差异。如果一审法官的法律解释不够准确或全面，二审法官可以依据更准确、合理的法律解释，对合同效力作出不同的判定。
新的法律规定或司法解释：
- 如果在一审判决后至二审审理期间，有新的法律规定或司法解释施行，并且这些新规定对合同效力的认定标准有所调整，二审法院可能会依据这些新规定改判合同有效。
二、二审改判的程序与流程
提起上诉：
- 当事人对一审判决不服的，需要在法定期限内向上一级人民法院提起上诉。上诉状应明确列出上诉的理由和请求。
二审审理：
- 二审法院将对上诉案件进行全面审理，包括重新审查案件事实和证据，以及评估一审法律适用的正确性。二审法院可能会要求当事人提供新的证据或进行进一步的辩论。
作出判决：
- 根据审理结果，二审法院可能维持原判、改判、撤销原判或发回重审。如果二审法院认为一审认定合同无效存在错误，并且符合改判条件，那么二审法院有权改判合同有效。
三、后续处理与注意事项
判决生效与执行：
- 二审判决一旦作出并送达当事人，即发生法律效力。当事人应当按照判决来履行相应的义务。如果一方不履行判决，另一方可以向法院申请强制执行。
再审程序的可能性：
- 在某些特殊情况下，如果当事人认为二审判决仍然存在错误，并且符合再审条件，可以向法院申请再审。再审程序是对已经发生法律效力的判决进行再次审理的一种程序。
法律咨询的必要性：
- 在处理合同纠纷过程中，由于涉及复杂的法律问题和程序规定，当事人最好咨询专业的法律人士以获取准确的法律意见和帮助。
综上所述，一审合同无效而二审认定合同有效的情况并不罕见。这主要依赖于二审法院对案件事实的重新审查、法律适用的重新评估以及二审程序的特定流程。当事人在处理此类纠纷时，应充分了解相关法律规定和程序要求，并咨询专业的法律人士以获取有效的法律支持。