当公司发现员工存在职务侵占行为并已经报案后，该员工应该如何处理，这是一个涉及法律责任、个人权益和公司利益的问题。以下是对此问题的详细解答：
一、员工应知晓的法律责任
首先，员工需要明确，职务侵占是一种违法行为，根据侵占的数额和情节，可能会面临刑事处罚。如果公司已经向公安机关报案，并且公安机关立案侦查，那么员工可能会面临刑事诉讼。在刑事诉讼中，如果员工被认定构成职务侵占罪，将会受到相应的刑事处罚，量刑会依据侵占的数额和具体情节而定。
二、员工应配合调查
保持冷静与配合：
- 员工在接到公安机关的调查通知后，应保持冷静，不要慌乱。
- 应积极配合公安机关的调查，如实陈述事实，提供相关证据。
了解自己的权利：
- 员工在配合调查的同时，也应了解自己的合法权益，如申请律师协助等。
三、员工应考虑的后续行动
寻求法律帮助：
- 员工可以寻求专业律师的帮助，了解自己的法律责任和应对策略。
- 律师可以协助员工分析案情，提供法律建议，并代理相关法律事务。
与公司协商：
- 在法律框架内，员工可以尝试与公司进行协商，探讨解决问题的可能性。
- 如果员工愿意退还侵占的财物或赔偿公司的经济损失，这可能会作为量刑时的一个考虑因素。
反思与改正：
- 无论结果如何，员工都应深刻反思自己的行为，认识到职务侵占的严重性。
- 如果员工有机会继续在公司工作，应严格遵守公司规章制度，不再犯类似错误。
四、对公司管理的建议
虽然这部分主要是针对公司的，但员工也可以从中得到启示，了解公司如何预防和管理类似事件：
完善管理制度：
- 公司应完善财务制度和监督机制，确保资金流动的透明性和合规性。
- 加强内部审计和风险控制，及时发现和纠正问题。
加强员工教育：
- 公司应定期对员工进行法律教育和职业道德培训，提高员工的法律意识和职业道德水平。
- 通过案例分析和警示教育，增强员工的责任感和风险意识。
鼓励举报与保护机制：
- 公司应鼓励员工积极举报职务侵占行为，设立专门的举报渠道。
- 对举报人给予适当的奖励和保护，确保其不会因举报而遭受不利待遇。
综上所述，当公司发现员工存在职务侵占行为并已经报案后，员工应知晓自己的法律责任、积极配合调查、寻求法律帮助并与公司协商解决问题。同时，员工也应从中吸取教训，加强自我约束和管理，避免再次犯类似错误。