自收自支事业单位在特定情况下是适用合同法的。具体来说：
不适用《劳动合同法》的情况：对于具有管理公共事务职能的自收自支事业单位，其员工如果是事业编制，那么通常不适用《劳动合同法》。这是因为这类单位及其员工的关系更多地受《事业单位人事管理条例》等特定法规调整，而不是一般的劳动合同法律。
适用《劳动合同法》的情况：然而，对于那些实现企业化管理的事业单位，它们与劳动者签署的是劳动合同。在这类单位中，如果员工与用人单位之间发生劳动合同争议，是可以依据《劳动合同法》来处理的。这意味着，对于这部分自收自支事业单位的员工来说，合同法是适用的，并且他们可以享受《劳动合同法》所提供的各项权益和保护。
综上所述，自收自支事业单位是否适用合同法，取决于该单位的具体性质和管理方式。如果单位实现企业化管理并与员工签署劳动合同，那么合同法就是适用的。反之，如果单位具有管理公共事务的职能且员工为事业编制，则通常不适用《劳动合同法》。如有进一步疑问或需要具体法律建议，请直接向我咨询。