关于“迟到几分钟是否扣底薪和出勤补助”的问题，这主要取决于公司的内部规章制度以及劳动合同中的相关约定。
结论前置：
- 若公司规章制度或劳动合同中明确规定迟到几分钟将扣除底薪和出勤补助，则公司有权按照此规定执行。
- 若公司规章制度或劳动合同中未明确规定，或规定不明确，则公司不能随意扣除员工的底薪和出勤补助。
详细分析：
公司规章制度与劳动合同的规定：
- 公司有权在规章制度中设定员工的行为规范，包括考勤制度。如果规章制度中明确规定了迟到几分钟将扣除底薪和出勤补助，且该规章制度已经过合法程序制定并公示，那么公司有权按照此规定执行。
- 同时，劳动合同是员工与公司之间约定的权利义务关系的法律文件。如果劳动合同中明确约定了迟到几分钟将扣除底薪和出勤补助，那么公司同样有权按照此约定执行。
规章制度与劳动合同未明确规定的情况：
- 如果公司规章制度或劳动合同中未明确规定迟到几分钟将扣除底薪和出勤补助，或者规定不明确、存在歧义，那么公司不能随意扣除员工的底薪和出勤补助。在这种情况下，公司应当遵循公平、公正的原则，合理处理员工的迟到问题。
- 此外，即使公司规章制度或劳动合同中有相关规定，但如果该规定违反了法律法规的强制性规定，或者显失公平、不合理，那么该规定也是无效的，公司不能依据此规定扣除员工的底薪和出勤补助。
法律建议：
- 对于员工而言，应当了解并遵守公司的规章制度和劳动合同中的约定，避免迟到等违纪行为的发生。
- 如果对公司的规章制度或劳动合同中的相关规定有异议，应当及时与公司进行沟通协商，或者寻求法律援助以维护自己的合法权益。
- 对于公司而言，应当制定合法、合理、明确的规章制度和劳动合同，确保员工的权益得到保障，同时也维护公司的正常运营秩序。
综上所述，迟到几分钟是否扣底薪和出勤补助，主要取决于公司的内部规章制度以及劳动合同中的相关约定。员工应当了解并遵守相关规定，公司也应当制定合法、合理、明确的规定以维护双方的权益。