针对您提出的“公司向劳动局备案12小时怎么办”的问题，首先我们需要明确，公司向劳动局备案的工作时间制度，通常涉及到的是综合计算工时工作制或不定时工作制的审批。以下是根据您提供的信息，结合一般流程给出的详细解答：

一、了解工时制度

1. 标准工时制度：通常情况下，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。
2. 综合计算工时工作制：适用于因工作情况特殊或受季节和自然条件限制，需安排劳动者集中作业无法实行标准工时制度的岗位。这种制度下，工作时间可以在一定周期内（如周、月、季、年）综合计算，但平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。
3. 不定时工作制：适用于因生产经营特点、工作情况特殊或岗位性质的关系，需要机动作业无法实行标准工时制度的岗位。这种制度下，工作时间不确定，由劳动者自行安排或根据工作需要灵活安排。

二、确定备案需求

公司若需要备案12小时工作制，首先需要判断该岗位是否适合实行综合计算工时工作制或不定时工作制。如果适合，则需要按照相关规定向劳动局提交申请。

三、准备申请材料

以北京市为例，申请综合计算工时工作制或不定时工作制需要提交以下材料：

1. 《北京市企业实行综合计算工时工作制和不定时工作制申报表》；
2. 申请说明书（需加盖用人单位公章）；
3. 企业工会或职工意见（需加盖用人单位公章，未成立工会的需提交全体职工同意的联名意见）；
4. 企业营业执照复印件（需加盖用人单位公章）；
5. 经办人身份证复印件（需加盖用人单位公章）；
6. 公示证明材料（需加盖用人单位公章）。

四、提交申请

将准备好的申请材料提交至公司工商登记注册地的区人力资源和社会保障局或相关审批部门。提交方式可能包括窗口办理、网上办理等，具体以当地规定为准。

五、等待审批

审批部门在收到申请后，会对申请材料进行审查。审查通过后，会作出准予实行不定时工作制或综合计算工时工作制的决定，并书面批复申请单位。如果申请不符合规定，审批部门会告知申请单位并说明理由。

六、公示与告知

申请单位在取得行政许可后，需要在规定时间内采取公示的方式将结果告知全体劳动者。

七、注意事项

1. 确保申请材料的真实性和完整性，否则将承担相应的法律后果。
2. 遵守相关法律法规和劳动局的规定，确保劳动者的合法权益得到保障。
3. 如果公司需要变更或终止已经备案的工时制度，也需要按照相关规定向劳动局提交申请。

综上所述，公司向劳动局备案12小时工作制需要按照相关规定和流程进行申请和审批。在申请过程中，公司需要准备齐全的申请材料，并确保申请内容的真实性和合法性。同时，公司也需要遵守相关法律法规和劳动局的规定，确保劳动者的合法权益得到保障。