针对您提出的“工伤单位超48小时备案怎么处理”的问题，首先我们需要明确一点：在工伤认定中，确实存在一个与“48小时”相关的重要规定，但这主要是关于在工作时间和工作岗位上突发疾病并在48小时内经抢救无效死亡的情况，这种情况下会被视同工伤。然而，您所提到的“超48小时备案”似乎是指单位在工伤发生后超过一定时间（这里假设您指的是超过48小时，但实际上相关法规规定的是30日内）才进行工伤认定申请的情况。

对于这种情况，我们可以按照以下步骤来处理：

1. 明确时间节点：

   • 单位应当在员工事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向用人单位注册登记地的区人力资源社会保障局提出工伤认定申请。
   • 如果单位未在这个时间内提出工伤认定申请，那么员工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，都有权直接向用人单位注册登记地的区人力资源社会保障局提出工伤认定申请。

2. 了解责任归属：

   • 如果单位未按规定在30日内提出工伤认定申请，那么在此期间发生的符合工伤待遇等有关费用，将由该用人单位负担。

3. 准备必要材料：

   • 无论是单位还是员工个人申请工伤认定，都需要准备相关的证明材料，如工伤事故报告、医疗证明、员工身份证明等。

4. 提交申请并跟进：

   • 将准备好的材料提交给当地的人力资源社会保障局，并跟进申请进度。如果申请被受理，等待进一步的工伤认定结果；如果申请被拒绝，了解拒绝的原因并考虑是否需要进行行政复议或提起行政诉讼。

5. 寻求法律援助：

   • 在整个过程中，如果遇到困难或疑问，可以寻求专业的法律援助，以确保自己的权益得到妥善保护。

综上所述，即使单位超过了48小时（实际上是30日内）才进行工伤认定申请，员工或其近亲属仍然有权在1年内提出申请。同时，单位也需要承担因未及时申请而产生的相关费用。希望这些信息能够对您有所帮助。