下班忘记打卡，公司制度要求申请事假并扣半天工资，这样做不一定合法，需具体情况具体分析。

1. 公司规章制度明确且合理的情况：

   • 如果公司的规章制度明确规定员工上下班必须打卡，且该制度经过民主程序制定并公示告知员工，那么员工未按规定打卡可能被视为违反公司规定。在此情况下，公司根据规章制度扣除相应工资或进行其他处罚，通常被认为是合法的。
   • 但需注意，扣款金额应合理，不能过度惩罚员工。例如，因一次忘记打卡就扣除大量工资显然不合理。同时，公司应提供补卡等补救措施，允许员工在特殊情况下（如设备故障、网络问题等）通过其他方式证明出勤。

2. 公司规章制度不明确或不合理的情况：

   • 若公司没有明确的打卡制度或相关规定未经民主程序制定和公示，则公司无权仅凭员工未打卡就扣除工资。此时，员工的权益受到法律保护。
   • 若公司随意以忘记打卡为由扣除员工工资，可能构成克扣工资的违法行为。根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者工资。员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁维护自身权益。

3. 特殊情况下的处理：

   • 如因自然灾害、突发疾病等不可抗力导致无法按时打卡，员工应及时向公司说明情况并提供相关证明。公司应根据实际情况灵活处理，避免机械执行打卡制度损害员工利益。
   • 对于忘记打卡的争议，双方可通过协商或第三方调解解决。

4. 法律建议：

   • 员工应首先了解公司的打卡制度和相关规定，确保自己清楚知晓并遵守。
   • 如果因忘记打卡被扣工资，员工可以与公司进行沟通，了解扣款的具体原因和依据，并表达自己的意见和诉求。
   • 如果沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

总之，下班忘记打卡是否会被扣工资，以及扣款的合法性，取决于公司的规章制度、扣款金额及目的等多种因素。员工应了解自己的权益和义务，并在必要时采取合适的措施维护自己的合法权益。