如医院本身应是业主，但城投公司却成为了业主，这涉及到了物权归属和可能的合同纠纷问题。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 物权归属的确认

1. 法律依据：根据《中华人民共和国物权法》第九条，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但法律另有规定的除外。
2. 分析：首先，需要确认医院是否拥有该物业的合法所有权或使用权。这通常通过查看房产证或相关土地使用权证明来确定。如果医院确实拥有这些证明文件，那么医院在法律上就是该物业的合法业主。

二. 合同纠纷的处理

1. 法律依据：根据《中华人民共和国合同法》第一百二十二条，因当事人一方的违约行为，侵害对方人身、财产权益的，受损害方有权选择依照本法要求其承担违约责任或者依照其他法律要求其承担侵权责任。
2. 分析：如果城投公司未经医院同意或未通过合法途径成为业主，这可能违反了医院与城投公司之间（如果有的话）的原始合同或协议。在这种情况下，医院可以依据合同法要求城投公司承担违约责任，包括恢复医院的业主身份或赔偿因此造成的损失。

三. 实际操作的建议

1. 查证并沟通：医院应首先查证自己的物权证明，并与城投公司进行沟通，了解其为何成为业主的详细情况。
2. 法律咨询与诉讼：如果沟通无果，医院可以寻求专业律师的法律咨询，并根据律师的建议决定是否通过诉讼来维护自己的权益。
3. 考虑和解：在诉讼之前，也可以考虑与城投公司进行和解谈判，以达成双方都能接受的解决方案。

我建议医院首先确认自己的物权证明，然后依据合同法与城投公司进行沟通或采取法律行动。如有进一步需要，您可以继续咨询我。