邻居将车库改为商铺，你可以向人民法院提起诉讼。以下是对此问题的详细分析：

法律依据

1. 《中华人民共和国民法典》第二百七十九条：业主不得违反法律、法规以及管理规约，将住宅改变为经营性用房。业主将住宅改变为经营性用房的，除遵守法律、法规以及管理规约外，应当经有利害关系的业主一致同意。
2. 《中华人民共和国民法典》第二百八十七条：业主对建设单位、物业服务企业或者其他管理人以及其他业主侵害自己合法权益的行为，有权请求其承担民事责任。
3. 《最高人民法院关于审理建筑物区分所有权纠纷案件适用法律若干问题的解释》第十条：业主将住宅改变为经营性用房，未依据民法典第二百七十九条的规定经有利害关系的业主一致同意，有利害关系的业主请求排除妨害、消除危险、恢复原状或者赔偿损失的，人民法院应予支持。

处理方式

1. 协商沟通：

   • 尝试与邻居友好协商，说明其行为可能带来的不利影响，要求其停止或采取有效措施减轻影响。

2. 告知业主委员会：

   • 若协商无果，应及时告知业主委员会，由业主委员会介入处理。

3. 向相关部门投诉：

   • 向当地的规划、住建、市场监管等部门反映情况，这些部门会依据相关规定进行调查处理。

4. 法律途径：

   • 若上述措施均未能解决问题，且邻居的行为已给你造成实际损失或严重影响生活，可依法向人民法院提起民事诉讼，要求邻居停止侵害、排除妨碍、赔偿损失。

注意事项

• 证据收集：在处理此类纠纷时，务必收集充分的证据（如照片、视频、证人证言、相关部门的处理意见等），以便在协商、调解或诉讼中有效维护自己的权益。
• 有利害关系业主的认定：通常包括本栋建筑物内的业主。其他栋业主若主张与自己有利害关系，需提供充分证据证明自身利益受损。

综上所述，邻居将车库改为商铺违反了相关法律法规，你有权采取多种措施维护自身权益。在协商、调解无果的情况下，可以向人民法院提起诉讼，要求邻居承担相应的法律责任。